Markdorf leží asi šesť kilometrov severne od Bodamského jazera na úpätí 754 m vysokého vrchu Gehrenberg.
Mesto Markdorf susedí s mestami Friedrichshafen na juhovýchode, Meersburg na juhozápade a Ravensburg na severovýchode.
Mesto Markdorf sa nachádza na švábskej barokovej ceste (Oberschwäbischen Barockstraße).
Rozhľadňa na vrchu Gehrenberg ponúka za dobrého počasia výhľad na asi 6 km vzdialené Bodamské jazero.
Stavby
V centre mesta
Katolícky kostol Sv. Mikuláš (Katholische Pfarrkirche St. Nikolaus) - gotickýkostol postavený v roku 1370, kaplnka z roku 1660 a hlavný oltár z roku 1871
Nemocnica Svätého ducha (Heilig-Geist-Spital) s kaplnkou St. Mauritius (Kapelle St. Mauritius) - stredoveká stavba s freskou z 15. storočia
Nemocničný kostol Sv. Peter a Pavol (Spitalkirche St. Peter und Paul) - barokovýkostol postavený v rokoch 1689 až 1700