Proteinsko savijanje

Proteinsko savijanje je proces kojim proteinska struktura zauzima svoj funkcionalni oblik ili konformaciju. To je fizički proces kojim se polipeptid savija u svoju karakterističnu i funkcionalnu tridimenzionalnu strukturu iz randomnog namotaja.^[1] Svaki protein postoji kao nesavijeni polipeptid ili randomni namotaj nakon translacije iz iRNK sekvence u linearni lanac aminokiselina. Međusobna interakcija aminokiselina proizvodi dobro definisanu tridimenzionu strukturu, savijenog proteina, poznatu kao prirodno stanje. Rezultirajuća tridimenziona struktura je određen aminokiselinskom sekvencom (Anfinsenova dogma).^[2]

Protein pre i posle savijanja.

Korektna tridimenziona struktura je esencijalna za funkciju, mada neki delovi funkcionalnih proteina mogu da ostanu nesavijeni.^[3] Posledica neuspešnog savijanja u prirodnu strukturu su neaktivni proteini koji su obično toksični. Nekoliko neurodegenerativnih i drugih bolesti su uzrokovane akumulacijom amiloidnih filamenata formiranih od nekorektno savijenih proteina.^[4] Mnoge alergije su posledica savijanja proteina, jer imunski sistem ne proizvodi antitela za određene proteinske strukture.^[5]

Povezano

• Ševronov grafik
• Denaturacija (biohemija)
• Folding (hemija)
• Folding@Home
• Foldit računarska igra
• Levintalni paradoks
• Dizajn proteina
• Proteinska dinamika
• Predviđanje strukture proteina
• Proteopatija
• Rosetta@home
• Statistički potencijal

Reference

1. Alberts Bruce, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walters (2002). „The Shape and Structure of Proteins”. Molecular Biology of the Cell; Fourth Edition. New York and London: Garland Science. ISBN 0-8153-3218-1.
2. Anfinsen, C. (1972). „The formation and stabilization of protein structure”. Biochem. J. 128 (4): 737–49. PMC 1173893. PMID 4565129.
3. Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer; Web content by Neil D. Clarke (2002). „3. Protein Structure and Function”. Biochemistry. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN 0-7167-4684-0.
4. Selkoe, Dennis J. (2003). „Folding proteins in fatal ways”. Nature 426 (6968): 900–904. DOI:10.1038/nature02264. PMID 14685251.
5. Alberts, Bruce, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walter. "Protein Structure and Function." Essential Cell Biology. Edition 3. New York: Garland Science, Taylor and Francis Group, LLC, 2010. Pg 120-170.

Literatura

• Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer; Web content by Neil D. Clarke (2002). „3. Protein Structure and Function”. Biochemistry. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN 0-7167-4684-0.
• Alberts Bruce, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, and Peter Walters (2002). „The Shape and Structure of Proteins”. Molecular Biology of the Cell; Fourth Edition. New York and London: Garland Science. ISBN 0-8153-3218-1.

Spoljašnje veze

• FoldIt - igra savijanja proteina Arhivirano 2021-01-04 na Wayback Machine-u
• Folding@Home Arhivirano 2008-06-16 na Wayback Machine-u
• Rosetta@Home