CDKN1B

CDKN1B (англ. cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, p27, Kip1) — ингибитор циклин-зависимой киназы 1B, продукт гена CDKN1B человека, член семейства белков Cip/Kip. Этот белок регулирует течение клеточного цикла, отвечает за его остановку в G1-фазе. CDKN1B подавляет активность комплексов циклин А/циклин-зависимая киназа 2 и циклин Е/циклин-зависимая киназа 2. Также он способен связываться с комплексами циклин типа D/циклин-зависимая киназа 4 и положительно или отрицательно регулировать их активность в зависимости от статуса фосфорилирования или стехиометрии комплекса^[5].

CDKN1B
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 2AST, 1H27, 1JSU
Идентификаторы
Псевдонимы	CDKN1B, CDKN4, KIP1, MEN1B, MEN4, P27KIP1, cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, cyclin dependent kinase inhibitor 1B
Внешние ID	OMIM: 600778 MGI: 104565 HomoloGene: 2999 GeneCards: CDKN1B
Расположение гена (человек) Хр. 12-я хромосома человека[1] Локус 12p13.1 Начало 12,685,498 bp[1] Конец 12,722,369 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 6-я хромосома мыши[2] Локус 6 G1|6 65.77 cM Начало 134,897,364 bp[2] Конец 134,902,476 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в ventricular zone lateral nuclear group of thalamus parietal pleura germinal epithelium Наибольшая экспрессия в lobe of cerebellum cumulus cell ventricular zone Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция связывание с белками плазмы protein phosphatase binding cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity protein kinase inhibitor activity protein kinase binding cyclin binding cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity Hsp70 protein binding protein-containing complex binding chaperone binding Компонент клетки цитоплазма цитозоль эндосома нуклеоплазма Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex клеточное ядро intracellular membrane-bounded organelle protein-containing complex Биологический процесс Notch signaling pathway regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest response to estradiol positive regulation of cell death response to hypoxia response to amino acid response to cadmium ion positive regulation of protein catabolic process response to organic cyclic compound cellular response to lithium ion cellular response to organic cyclic compound response to peptide hormone смерть клетки негативная регуляция апоптоза слух response to glucose potassium ion transport regulation of cell population proliferation negative regulation of cell growth negative regulation of epithelial cell proliferation involved in prostate gland development позитивная регуляция пролиферации клеток positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity negative regulation of epithelial cell proliferation positive regulation of microtubule polymerization inner ear development cellular response to antibiotic клеточный цикл negative regulation of phosphorylation negative regulation of transcription, DNA-templated autophagic cell death негативная регуляция пролиферации клеток negative regulation of mitotic cell cycle negative regulation of kinase activity positive regulation of cell cycle negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation Плацентация regulation of exit from mitosis regulation of lens fiber cell differentiation negative regulation of cyclin-dependent protein kinase activity negative regulation of cell cycle negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity G1/S transition of mitotic cell cycle Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 1027 12576 Ensembl ENSG00000111276 ENSMUSG00000003031 UniProt P46527 P46414 RefSeq (мРНК) NM_004064 NM_009875 RefSeq (белок) NP_004055 NP_034005 Локус (UCSC) Chr 12: 12.69 – 12.72 Mb Chr 6: 134.9 – 134.9 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Распространение и внутриклеточная локализация

CDKN1B, был обнаружен во всех тканях, которые были протестированы. Количество мРНК CDKN1B постоянно на всех стадиях клеточного цикла, и регуляция количества белка и его активности происходит на уровне трансляции, контроля стабильности и посттрансляционных модификаций^[6].

CDKN1B — ядерно-цитоплазматический белок, его внутриклеточная локализация регулируется посттрансляционными модификациями. Свои ингибиторные функции он выполняет в ядре, после его перемещения в цитоплазму становится возможным дальнейшее продвижение клетки по циклу. Нарушение баланса между количеством ядерного и цитоплазматического CDKN1B обнаруживается в некоторых злокачественных опухолях^[6].

Роль в развитии заболеваний

В соответствии с его ролью в регуляции пролиферации клеток, CDKN1B является антионкобелком, а кодирующий его ген — геном-супрессором опухолей. Супрессорная роль CDKN1B означает, что инактивирующие мутации в этом гене сопровождаются формированием опухолей.

Мутации в гене CDKN1B обуславливают предрасположенность к развитию множественных опухолей эндокринных желёз у человека и крыс^[7]. Это заболевание, описанное на примере одной семьи, получило название множественной эндокринной неоплазии IV типа.

Была установлена связь между определёнными аллельными вариантами гена CDKN1B и предрасположенностью к раку предстательной железы. Один из вариантов однонуклеотидного полиморфизма являются замены 326T/G (V109G). Показано, что гомозиготность по варианту 326T ассоциированна с повышенным риском развития распространённой карциномы простаты. Другим примером является полиморфизм −79C/T, при этом наличие в генотипе человека аллели C сопряжено с повышенным риском развития рака простаты и других органов^[8].

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000111276 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000003031 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. CDKN1B в базе данных UniProt  (неопр.). Дата обращения: 12 ноября 2013. Архивировано 25 сентября 2017 года.
6. Mitrea D. M., Yoon M. K., Ou L., Kriwacki R. W. Disorder-function relationships for the cell cycle regulatory proteins p21 and p27 // Biol Chem. — 2012. — Т. 393, вып. 4. — С. 259—274. — doi:10.1515/hsz-2011-0254. — PMID 23029651.
7. Pellegata N. S., Quintanilla-Martinez L., Siggelkow H., Samson E., Bink K., Höfler H., Fend F., Graw J., Atkinson M. J. Germ-line mutations in p27Kip1 cause a multiple endocrine neoplasia syndrome in rats and humans // Proc Natl Acad Sci U S A. — 2006. — Т. 103, вып. 42. — С. 15558—15563. — PMID 17030811. Архивировано 25 мая 2021 года.
8. Chang B. L., Zheng S. L., Isaacs S. D., Wiley K. E., Turner A., Li G., Walsh P. C., Meyers D. A., Isaacs W. B., Xu J. A polymorphism in the CDKN1B gene is associated with increased risk of hereditary prostate cancer // Cancer Res. — 2004. — Т. 64, вып. 6. — С. 1997—1999. — PMID 15026335. Архивировано 11 июля 2015 года.