Гистондеацетилаза 6

Гистондеацетилаза 6 (англ. Histone deacetylase 6) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC6^[5][6].

Гистондеацетилаза 6
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 3C5K, 3GV4, 3PHD, 5EDU, 5KH7
Идентификаторы
Псевдонимы	HDAC6, CPBHM, HD6, PPP1R90, JM21, histone deacetylase 6
Внешние ID	OMIM: 300272 MGI: 1333752 HomoloGene: 31353 GeneCards: HDAC6
Расположение гена (человек) Хр. X-хромосома человека[1] Локус Xp11.23 Начало 48,801,377 bp[1] Конец 48,824,982 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. X-хромосома мыши[2] Локус X A1.1|X 3.58 cM Начало 7,796,359 bp[2] Конец 7,814,128 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в right hemisphere of cerebellum right lobe of liver right testis left testis body of uterus ventricular zone Наибольшая экспрессия в central gray substance of midbrain CA3 field medullary collecting duct dorsomedial hypothalamic nucleus choroid plexus of fourth ventricle Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция histone deacetylase binding misfolded protein binding связывание с ионом металла enzyme binding NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific) beta-catenin binding zinc ion binding polyubiquitin modification-dependent protein binding связывание с белками плазмы tau protein binding dynein complex binding Hsp90 protein binding histone deacetylase activity microtubule binding alpha-tubulin binding ubiquitin binding beta-tubulin binding actin binding гидролазная активность ubiquitin protein ligase binding tubulin deacetylase activity RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding protein deacetylase activity acetylspermidine deacetylase activity Компонент клетки цитозоль perinuclear region of cytoplasm Кавеола микротрубочка клеточное ядро multivesicular body cell projection microtubule associated complex aggresome dynein complex histone deacetylase complex перикарион аксон тельца включения дендрит cell leading edge cytoplasmic microtubule cell body neuron projection нуклеоплазма цитоплазма protein-containing complex Биологический процесс Hsp90 deacetylation protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins response to organic substance cellular response to topologically incorrect protein tubulin deacetylation regulation of establishment of protein localization ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway response to growth factor intracellular protein transport aggresome assembly negative regulation of proteolysis histone H3 deacetylation positive regulation of signal transduction peptidyl-lysine deacetylation response to misfolded protein ДНК-зависимая регуляция транскрипции regulation of protein stability ubiquitin-dependent protein catabolic process mitochondrion localization positive regulation of epithelial cell migration regulation of fat cell differentiation транскрипция, ДНК-зависимая regulation of autophagy of mitochondrion polyubiquitinated misfolded protein transport response to toxic substance positive regulation of hydrogen peroxide-mediated programmed cell death regulation of microtubule-based movement regulation of signaling receptor activity protein polyubiquitination protein deacetylation negative regulation of hydrogen peroxide metabolic process regulation of autophagy negative regulation of oxidoreductase activity regulation of androgen receptor signaling pathway negative regulation of transcription, DNA-templated cellular response to misfolded protein positive regulation of chaperone-mediated protein complex assembly regulation of gene expression, epigenetic negative regulation of protein-containing complex disassembly аутофагия negative regulation of microtubule depolymerization lysosome localization histone deacetylation cellular response to hydrogen peroxide collateral sprouting dendritic spine morphogenesis cilium assembly regulation of macroautophagy parkin-mediated stimulation of mitophagy in response to mitochondrial depolarization positive regulation of mitophagy in response to mitochondrial depolarization chromatin organization positive regulation of protein oligomerization protein-containing complex disassembly positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation polyamine deacetylation spermidine deacetylation Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 10013 15185 Ensembl ENSG00000094631 ENSMUSG00000031161 UniProt Q9UBN7 Q9Z2V5 RefSeq (мРНК) NM_006044 NM_001321225 NM_001321226 NM_001321227 NM_001321228 NM_001321229 NM_001321230 NM_001321231 NM_001130416 NM_010413 RefSeq (белок) NP_001308154 NP_001308155 NP_001308156 NP_001308157 NP_001308158 NP_001308159 NP_001308160 NP_006035 NP_001123888 NP_034543 Локус (UCSC) Chr X: 48.8 – 48.82 Mb Chr X: 7.8 – 7.81 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Функция

Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и процесса развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хроматина и влияет на транскрипцию. Гистондеацетилаза 6 относится к классу II семейства гистондезацетилаз/acuc/APHA. Он содержит два каталитических домена, которые функционируют независимо друг от друга. Белок обладает гистондеацетилазной активностью и подавляет транскрипцию^[7].

Клиническая значимость

Мутации в этом гене были связаны с болезнью Альцгеймера^[8].

Суперэкспрессия этого белка коррелирует с онкогенезом и выживаемостью клеток, а также способствует метастазированию раковых клеток^[9].

Функции

Гистондеацетилаза 6 участвует в разборке ресничек клетки, что необходимо для начала митоза^[10]. Также способствует миграции клеток и катализирует деацетилирование α-тубулина^[11], что может способствовать метастазированию раковых опухолей^[9]. Влияет на транскрипцию и трансляцию путём регулирования белка теплового шока Hsp90 и стресс-гранул соответственно^[9].

Известен высоким сродством к убиквитинированным белкам^[12]. Гистондеацетилаза 6 играет важную роль в формировании стресс-гранул^[англ.]; при фармакологическом ингибировании или при подавлении синтеза гистондеацетилазы 6 на генетическом уровне прекращается образование стресс-гранул.

Взаимодействия

HDAC6, как было выявлено, взаимодействует с HDAC11^[13] и ZBTB16^[14] .

HDAC6 также взаимодействует с белком G3BP1^[англ.] стресс-гранул^[12].

См. также

• Деацетилазы гистонов