ARNT

ARNT (сокр. от англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator) — ядерный транслокатор (переносчик) рецептора ароматических углеводородов (AHR), представляет собой белок, который образует комплекс с лиганд-связанным рецептором AHR и необходим для рецепторной функции. Кодируется одноимённым геном ARNT, локализован на коротком плече (p-плече) 1-хромосомы^[5].

ARNT
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2K7S, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4LPZ, 4XT2
Идентификаторы
Псевдонимы	ARNT, HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
Внешние ID	OMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: ARNT
Расположение гена (человек) Хр. 1-я хромосома человека[1] Локус 1q21.3 Начало 150,809,713 bp[1] Конец 150,876,708 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 3-я хромосома мыши[2] Локус 3 F2.1|3 40.74 cM Начало 95,341,699 bp[2] Конец 95,404,551 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в epithelium of colon sural nerve stromal cell of endometrium ectocervix body of uterus Наибольшая экспрессия в muscle of thigh cumulus cell Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция sequence-specific DNA binding ДНК-связывающий protein dimerization activity DNA-binding transcription factor activity transcription coactivator activity aryl hydrocarbon receptor binding transcription factor binding связывание с белками плазмы protein heterodimerization activity transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific гомодимеризация белка sequence-specific double-stranded DNA binding nuclear receptor activity Компонент клетки цитоплазма transcription regulator complex нуклеоплазма RNA polymerase II transcription regulator complex клеточное ядро ядерные тельца Биологический процесс positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway дифференцировка клеток response to hypoxia ДНК-зависимая регуляция транскрипции positive regulation of endothelial cell proliferation regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress positive regulation of erythrocyte differentiation embryonic placenta development mRNA transcription by RNA polymerase II positive regulation of protein sumoylation транскрипция, ДНК-зависимая ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции intracellular receptor signaling pathway regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia positive regulation of vascular endothelial growth factor production positive regulation of glycolytic process положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор positive regulation of hormone biosynthetic process xenobiotic metabolic process Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 405 11863 Ensembl ENSG00000143437 ENSMUSG00000015522 UniProt P27540 P53762 RefSeq (мРНК) NM_001197325 NM_001286035 NM_001286036 NM_001668 NM_178426 NM_178427 NM_001350224 NM_001350225 NM_001350226 NM_001037737 NM_009709 RefSeq (белок) NP_001184254 NP_001272964 NP_001272965 NP_001659 NP_848514 NP_001337153 NP_001337154 NP_001337155 NP_001032826 NP_033839 Локус (UCSC) Chr 1: 150.81 – 150.88 Mb Chr 3: 95.34 – 95.4 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Закодированный белок также идентифицирован как бета-субъединица гетеродимерного транскрипционного фактора — фактора, индуцируемого гипоксией (HIF1β). Транслокация t(1; 12) (q21; p13), приводящая к слипанию с белком TEL-ARNT, связана с острым миелобластическим лейкозом. Для этого гена описаны три альтернативные сплайсированные варианты, кодирующие различные изоформы.

Рецептор ароматических углеводородов (АHR) участвует в индукции нескольких ферментов, которые участвуют в метаболизме ксенобиотиков. Лиганд-цитозольная форма рецептора ароматических углеводородов комплексно связана с белком теплового шока (Hsp90). Связывание лигандов, включаящие в себя диоксины (ТХДД) и полициклические ароматические углеводороды (ПАУ), приводит к транслокации (перемещению) лигандсвязывающей субъединицы только в^[6] клеточное ядро. Индукция ферментов, участвующих в метаболизме ксенобиотиков, происходит за счёт связывания лиганд-связанного AhR с чувствительными к ксенобиотическими элементами в промоторных областях генов для этих ферментов.

Взаимодействия с другими белками

ARNT взаимодействует со следующими белками:

• AIP,^[7][8]
• AHR,^{[9][10][11][12]}
• EPAS1,^[13]
• HIF1A,^[13][14]
• NCOA2,^[15][15]
• SIM1,^[14][16] и
• SIM2.^{[14][16][17][18]}

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143437 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015522 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:700 (англ.). Дата обращения: 21 сентября 2017. Архивировано 21 сентября 2017 года.
6. Hughes D., Guttenplan J. B., Marcus C. B., Subbaramaiah K., Dannenberg A. J. Heat Shock Protein 90 Inhibitors Suppress Aryl Hydrocarbon Receptor-Mediated Activation of CYP1A1 and CYP1B1 Transcription and DNA Adduct Formation (англ.) // Cancer Prevention Research. — 2008. — 1 November (vol. 1, no. 6). — P. 485—493. — ISSN 1940-6207. — doi:10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149. [исправить]
7. Carver L.A., Bradfield C.A. Ligand-dependent interaction of the aryl hydrocarbon receptor with a novel immunophilin homolog in vivo (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — April (vol. 272, no. 17). — P. 11452—11456. — doi:10.1074/jbc.272.17.11452. — PMID 9111057.
8. Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I. The hsp90 chaperone complex regulates intracellular localization of the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2001. — April (vol. 21, no. 7). — P. 2594—2607. — doi:10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001. — PMID 11259606. — PMC 86890.
9. Lindebro M.C., Poellinger L., Whitelaw M.L. Protein-protein interaction via PAS domains: role of the PAS domain in positive and negative regulation of the bHLH/PAS dioxin receptor-Arnt transcription factor complex (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1995. — July (vol. 14, no. 14). — P. 3528—3539. — PMID 7628454. — PMC 394421.
10. Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson J.A., Poellinger L. Ligand-dependent recruitment of the Arnt coregulator determines DNA recognition by the dioxin receptor (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1993. — April (vol. 13, no. 4). — P. 2504—2514. — PMID 8384309. — PMC 359572.
11. Yamaguchi Y., Kuo M.T. Functional analysis of aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator interactions with aryl hydrocarbon receptor in the yeast two-hybrid system (англ.) // Biochemical Pharmacology^[англ.] : journal. — 1995. — October (vol. 50, no. 8). — P. 1295—1302. — doi:10.1016/0006-2952(95)02016-6. — PMID 7488247.
12. Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Identification of a novel mechanism of regulation of Ah (dioxin) receptor function (англ.) // Genes & Development : journal. — 1999. — January (vol. 13, no. 1). — P. 20—5. — doi:10.1101/gad.13.1.20. — PMID 9887096. — PMC 316371.
13. Hogenesch J.B., Chan W.K., Jackiw V.H., Brown R.C., Gu Y.Z., Pray-Grant M., Perdew G.H., Bradfield C.A. Characterization of a subset of the basic-helix-loop-helix-PAS superfamily that interacts with components of the dioxin signaling pathway (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — March (vol. 272, no. 13). — P. 8581—8593. — doi:10.1074/jbc.272.13.8581. — PMID 9079689.
14. Woods S.L., Whitelaw M.L. Differential activities of murine single minded 1 (SIM1) and SIM2 on a hypoxic response element. Cross-talk between basic helix-loop-helix/per-Arnt-Sim homology transcription factors (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — March (vol. 277, no. 12). — P. 10236—10243. — doi:10.1074/jbc.M110752200. — PMID 11782478.
15. Beischlag T.V., Wang S., Rose D.W., Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson W.E., Probst M.R., Rosenfeld M.G., Hankinson O. Recruitment of the NCoA/SRC-1/p160 family of transcriptional coactivators by the aryl hydrocarbon receptor/aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — June (vol. 22, no. 12). — P. 4319—4333. — doi:10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002. — PMID 12024042. — PMC 133867.
16. Probst M.R., Fan C.M., Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Two murine homologs of the Drosophila single-minded protein that interact with the mouse aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — February (vol. 272, no. 7). — P. 4451—4457. — doi:10.1074/jbc.272.7.4451. — PMID 9020169.
17. Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2004. — January (vol. 24, no. 2). — P. 608—616. — doi:10.1128/mcb.24.2.608-616.2004. — PMID 14701734. — PMC 343817.
18. Moffett P., Reece M., Pelletier J. The murine Sim-2 gene product inhibits transcription by active repression and functional interference (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — September (vol. 17, no. 9). — P. 4933—4947. — doi:10.1128/mcb.17.9.4933. — PMID 9271372. — PMC 232345.