В XVIII веке и до 1868 года улица носила имя Морской[1][2] по находившемуся неподалёку Санкт-Петербургскому Морскому госпиталю. По другим данным, она же с 1799 по 1846 год называлась Компанейской[2].
21 октября1949 года в связи с 75-летием со дня рождения академика С. В. Лебедева улица получила название улица Лебедева. С 1956 года улица носит современное название — улица Академика Лебедева.
дом 2 / Выборгская набережная, 1 — здание Естественно-исторического института Медико-хирургической (Военно-медицинской) академии. 1858—1863 год. Архитекторы И. Д. Черник, В. Ф. Андриевский, К. Я. Соколов.
В 1859 году перед зданием был открыт памятник Я. В. Виллие (скульптор Д. И. Иенсен, архитектор А. И. Штакеншнейдер). В 1949 году, в разгар компании борьбы с космополитизмом, памятник был демонтирован[4] и только в 1964 году вновь установлен, но уже в парке Военно-медицинской академии, находящемся за штабом. В постсоветскую эпоху, несмотря на статус наследия федерального уровня[5], памятник сильно пострадал: были утрачены украшавшие его бронзовые барельефы, рассказывающие о жизни Я. В. Виллие[6].
За зданием на Большом Сампсониевскоом проспекте построен комплекс «Монблан». Это сооружение более чем в полтора раза превышает городской высотный регламент[7] и, по мнению специалистов, необратимо искажает историко-архитектурные панорамы берегов Невы[8]. Вид на ансамбль главного здания Академии также сильно пострадал.
дом 10 — в этом доме в квартире номер 4 с 1924 и до своей смерти в 1934 году жил С. В. Лебедев и его жена, художница-график А. П. Остроумова-Лебедева с 1924 по 1955 год. На доме установлена мемориальная доска. В настоящее время в здании располагается гостиница «Империя Парк».
дом 12 — доходный дом страхового о-ва «Жизнь», архитектор Р. И. Кригер (1912—1913 год).
дом 16—20 — комплекс зданий Михайловского артиллерийского училища
дом 37 — комплекс зданий Военно-медицинской академии со сквером и часовней, построенной в 1911 году по проекту военного инженера Николая Карловича Герле[9], среди них Здание анатомического института.
Городские имена сегодня и вчера: Петербургская топонимика/сост. С. В. Алексеева, А. Г. Владимирович, А. Д. Ерофеев и др.— 2-е изд., перераб. и доп.— СПб.: Лик, 1997.— 288с.— (Три века Северной Пальмиры).— ISBN 5-86038-023-2.
Санкт-Петербургские ассамблеиАрхивировано 25февраля 2007года. по: Бройтман Л. И. Адресный указатель к кн: Гордин А. М., Гордин М. А. Пушкинский век: Панорама столичной жизни. — СПб., 1995. — С. 377—408.#102. Санкт-Петербург. Петроград. Ленинград: Энциклопедический справочник. — М., 1992.
Лев УспенскийЗаписки старого петербуржца, Л.: Лениздат, 1970 г. 512 с.
Горбачевич К. С., Хабло Е. П.Почему так названы?: О происхождении названий улиц, площадей, островов, рек и мостов Ленинграда.— 3-е изд., испр. и доп.— Л.: Лениздат, 1985.— С.24—25.— 511с.
Городские имена сегодня и вчера: Петербургская топонимика/сост. С. В. Алексеева, А. Г. Владимирович, А. Д. Ерофеев и др.— 2-е изд., перераб. и доп.— СПб.: Лик, 1997.— С.21.— 288с.— (Три века Северной Пальмиры).— ISBN 5-86038-023-2.