Тромбоспондин-1

У этого термина существуют и другие значения, см. TSP.

Тромбоспондин-1 (англ. thrombospondin 1, TSP1) — один из пяти известных тромбоспондинов, адгезивных белков, регулирующих взаимодействия клеток между собой и с внеклеточным матриксом. После синтеза молекулы тромбоспондина-1 объединяются в гомотримеры, взаимодействующие со множеством рецепторов, в том числе CD36, CD47 и интегринами. В одном исследовании показано взаимодействие TSP1 с рилиновыми рецепторами VLDLR и ApoER2 в ростральном миграционном тракте^[5].

Тромбоспондин-1
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1LSL, 1UX6, 1Z78, 1ZA4, 2ERF, 2ES3, 2OUH, 2OUJ, 3R6B, 5FOE
Идентификаторы
Псевдонимы	THBS1, THBS, THBS-1, TSP, TSP-1, TSP1, thrombospondin 1
Внешние ID	OMIM: 188060 MGI: 98737 HomoloGene: 31142 GeneCards: THBS1
Расположение гена (человек) Хр. 15-я хромосома человека[1] Локус 15q14 Начало 39,581,079 bp[1] Конец 39,599,466 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 2-я хромосома мыши[2] Локус 2 E5|2 59.34 cM Начало 117,942,357 bp[2] Конец 117,957,614 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в stromal cell of endometrium left uterine tube upper lobe of left lung Наибольшая экспрессия в stroma of bone marrow body of femur cumulus cell skin of external ear endocardial cushion Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция calcium ion binding heparin binding extracellular matrix binding fibroblast growth factor binding phosphatidylserine binding proteoglycan binding collagen V binding fibrinogen binding low-density lipoprotein particle binding integrin binding laminin binding fibronectin binding связывание похожих белков transforming growth factor beta binding связывание с белками плазмы extracellular matrix structural constituent Компонент клетки endoplasmic reticulum lumen альфа-гранула тромбоцитов поверхность клетки эндоплазматический ретикулум экзосома внеклеточный матрикс secretory granule platelet alpha granule lumen Фибриноген Саркоплазматический ретикулум наружная сторона клеточной мембраны цитоплазма внеклеточное пространство внеклеточная область collagen-containing extracellular matrix Биологический процесс positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway cellular response to heat negative regulation of fibrinolysis protein O-linked fucosylation response to progesterone response to magnesium ion positive regulation of translation negative regulation of endothelial cell migration negative regulation of cell-matrix adhesion negative regulation of long-chain fatty acid import across plasma membrane positive regulation of reactive oxygen species metabolic process positive regulation of blood coagulation positive regulation of blood vessel endothelial cell migration positive regulation of macrophage chemotaxis позитивная регуляция сигналов от протеинкиназы В negative regulation of plasminogen activation negative regulation of blood vessel endothelial cell migration negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway response to endoplasmic reticulum stress positive regulation of endothelial cell apoptotic process response to unfolded protein positive regulation of chemotaxis negative regulation of cGMP-mediated signaling positive regulation of phosphorylation воспалительная реакция negative regulation of focal adhesion assembly chronic inflammatory response negative regulation of nitric oxide mediated signal transduction engulfment of apoptotic cell extracellular matrix organization positive regulation of macrophage activation sprouting angiogenesis негативная регуляция апоптоза response to glucose positive regulation of angiogenesis response to calcium ion positive regulation of transforming growth factor beta1 production агрегация клеток behavioral response to pain иммунный ответ negative regulation of interleukin-12 production positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process response to hypoxia positive regulation of cell migration platelet degranulation negative regulation of endothelial cell chemotaxis negative regulation of endothelial cell proliferation positive regulation of endothelial cell migration negative regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway peptide cross-linking negative regulation of antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II negative regulation of dendritic cell antigen processing and presentation negative regulation of angiogenesis миграция клеток positive regulation of fibroblast migration response to testosterone cellular response to tumor necrosis factor cellular response to growth factor stimulus positive regulation of transforming growth factor beta production response to mechanical stimulus позитивная регуляция пролиферации клеток positive regulation of smooth muscle cell proliferation regulation of megakaryocyte differentiation negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis negative regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis negative regulation of sprouting angiogenesis Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 7057 21825 Ensembl ENSG00000137801 ENSMUSG00000040152 UniProt P07996 P35441 RefSeq (мРНК) NM_003246 NM_011580 NM_001313914 RefSeq (белок) NP_003237 н/д Локус (UCSC) Chr 15: 39.58 – 39.6 Mb Chr 2: 117.94 – 117.96 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Примечания

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137801 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040152 - Ensembl, May 2017
3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Blake S.M., Strasser V., Andrade N., et al. Thrombospondin-1 binds to ApoER2 and VLDL receptor and functions in postnatal neuronal migration (англ.) // The EMBO journal^[англ.] : journal. — 2008. — October. — doi:10.1038/emboj.2008.223. — PMID 18946489.