Гидовая РНК

Гидовая РНК, гРНК — это РНК, которые опосредуют вставки уридиновых нуклеотидов в мРНК у трипаносом в процессе редактирования РНК.^[1][2][3] гРНК закодированы отдельными районами генома кинетопласта.^[4]

Механизм действия

5'-конец гРНК гибридизуется с коротким районом нередактированной пре-мРНК, называемым якорной последовательностью, в то время как 3'-конец таких РНК является матрицей для редактирования. Многие гРНК не гибридизуются с якорной последовательностью первичного транскрипта, но гибридизуются с частично редактированным транскриптом. Поэтому редактирование пре-мРНК трипаносом начинается обычно около 3'-конца и продвигается к 5'-концу в ходе повторяющегося процесса, который требует наличия нескольких разных гРНК, которые последовательно связываются с якорной последовательностью частично редактированных участков. Остается не совсем понятным, для чего кинетопласты трипаносом используют столь усложенный механизм образования мРНК. Функции многих гРНК не изучены.^[5]

Примечания

1. Stuart KD, Schnaufer A, Ernst NL, Panigrahi AK. Complex management: RNA editing in trypanosomes // Trends Biochem Sci. — 2005. — Т. 30, № 2. — С. 97-105.
2. Madison-Antenucci S, Grams J, Hajduk SL. Editing machines: the complexities of trypanosome RNA editing // Cell. — 2002. — Т. 108, № 4. — С. 435-438.
3. Stuart K, Allen TE, Kable ML, Lawson S. Kinetoplastid RNA editing: complexes and catalysts // Curr Opin Chem Biol. — 1997. — Т. 1, № 3. — С. 340-346.
4. Uliel S, Liang XH, Unger R, Michaeli S. Small nucleolar RNAs that guide modification in trypanosomatids: repertoire, targets, genome organisation, and unique functions // Int J Parasitol. — 2004. — Т. 34, № 4. — С. 445-454.
5. Stuart K, Panigrahi AK. RNA editing: complexity and complications // Mol Microbiol. — 2002. — Т. 45, № 3. — С. 591-596.

Литература

• Gurbachan S. Miglani. RNAs: Their Processing and Function // Advanced Genetics. — CRC Press, 2002. — С. 257—259. — 665 с. — ISBN 0849324254.
• Bruce Alberts. RNA Editing Can Change the Meaning of the RNA Message // Molecular Biology of the Cell. — Garland Science, 2007. — С. 483—484. — 1601 с. — ISBN 0815341113.
• Simpson L, Thiemann OH, Savill NJ, Alfonzo JD, Maslov DA. Evolution of RNA editing in trypanosome mitochondria // Proc Natl Acad Sci U S A. — 2000. — Т. 97, № 13. — С. 6986-6993. — Обзорная статья об эволюции редактирования РНК у Трипаносом на английском языке, находится в свободном доступе

См. также

Редактирование РНК