Богатая коллекция документов, связанных с жизнью и деятельностью Н. И. Пирогова, его личные вещи, медицинские инструменты, прижизненные издания его произведений хранятся в фондах Военно-медицинского музея в Петербурге. Особый интерес представляют двухтомная рукопись учёного «Вопросы жизни. Дневник старого врача» и оставленная им предсмертная записка с указанием диагноза своей болезни.
Памятник в Санкт-Петербурге (Загородный просп. 47 — возле Военно-медицинской Академии)
Бюст Пирогова у входа в здание Филиала «Лунёво» Московской ГКБ № 1 им. Н. И. Пирогова, расположенного в деревне Лунёво Солнечногорского района Московской области.
Бюст Пирогова в саду ГАУЗ КО «Областной Клинический Центр Охраны здоровья шахтёров», г. Ленинск-Кузнецкий.
Мемориальный музей Н. И. Пирогова в Санкт-Петербурге был открыт в 1897 году (снесён в 1969 году при строительстве гостиницы «Ленинград»). Музейная экспозиция восстановлена в 2018 году как Музей Н. И. Пирогова в рамках Военно-медицинского музея.[1]
В честь Н. И. Пирогова назван астероид 2506 Pirogov.
В Москве именем Н. И. Пирогова названы две улицы. В районе Большой и Малой Пироговских улиц в Москве сосредоточены учебные и административные корпуса, а также клинические базы РГМУ и ПМГМУ им. И. М. Сеченова. Его именем названа школа.
Имя Н. И. Пирогова носит Российский национальный медико-хирургический центр с клиническими подразделениями в Москве, Санкт-Петербурге, Туапсе и Мурманске.
В Самаре его именем названа городская больница. На территории больницы находится памятник Н. И. Пирогову.
В Жигулевске есть улица Пирогова. Причем на схеме "Увековечение памяти Пирогова" в музее-усадьбе вместо города Жигулевска указан Тольятти, однако улицы Пирогова в Тольятти нет. Ссылка На другом варианте схемы упоминания о Жигулевске нет.[5]
В Тамбове его именем названа улица в центре города.
В Оренбурге имя Н. И. Пирогова носит одна из городских больниц.
В Рыбинске имя Н. И. Пирогова носит городская больница № 2.
В Пятигорске есть здание, носящее название «Пироговские ванны», где получали бальнеолечение (бальнео-физиотерапевтические процедуры) по методу, разработанному Н. И. Пироговым. Эта лечебница действует и сейчас. На её стене — бронзовый профиль Пирогова. Также в городе на улице Пирогова располагается медгородок (горбольница № 1).
Именем Н.И. Пирогова названа гора высотой 373 метра, вблизи города Южно-Сахалинска, так же с ним связано название расположенной неподалеку горы Медика высотой 785 метров.
В районе улицы Пирогова в Улан-Удэ сгруппированы Республиканская больница, Республиканская станция переливания крови, Перинатальный центр, Клинический госпиталь ветеранов войн, Республиканская стоматологическая поликлиника и другие медицинские учреждения
В Самарском медицинском институте разработан интерактивный анатомический стол «Пирогов»[6]
В 2021 году Указом Президента РФ учреждён орден Пирогова.
В Симферополе несколько мемориальных досок на зданиях, где в годы Крымской войны размещались госпитали, в которых работал Пирогов.
В Саках в честь Пирогова назван военный санаторий, перед входом в который установлен памятник.
в Керчи — бюст Пирогова в сквере на ул. Пирогова .
В черте Винницы в с. Пирогово находится музей-усадьба Н. И. Пирогова, в километре от которой располагается церковь-усыпальница, где покоится забальзамированное тело выдающегося хирурга (Мавзолей Пирогова);
Санаторий им. Н. И. Пирогова расположен в парковой зоне северо-восточной части г. Одессы, на берегу Куяльницкого лимана в 13 км от центра города (Куяльницкий курорт).
Улица Пирогова в Киеве проходит от станции метро «Университет» до улицы Богдана Хмельницкого, на углу которых располагаются: музей истории медицины (здание анатомического театра — одно из лучших в Европе, — здесь же работал великий хирург и просветитель Н. И. Пирогов) и поликлиника № 1 Шевченковского района со станцией скорой медицинской помощи.
Памятник в Днепре (ул. Старокозацкая, возле военного госпиталя).
Бюст Пирогова у входа в здание 1 городской больницы Луганска.
Бюст Пирогова в сквере на территории БСМП (больница скорой медицинской помощи) в г. Николаеве
В Болгарии в знак признательности Н. И. Пирогову воздвигнуто 26 обелисков, 3 ротонды и памятник в Скобелевском парке в Плевне. В деревне Бохот, на том месте, где стояла русская 69-я военно-временная больница, создан парк-музей «Н. И. Пирогов».[7]
В 1951 году в Софии была создана первая в Болгарии больница скорой медицинской помощи, названная именем Н. И. Пирогова. Позже больница многократно меняла своё название — на «Институт скорой медицинской помощи», «Республиканский научно-практический институт скорой медицинской помощи», «Научный институт спешной медицины», «Многопрофильная больница для активного лечения и скорой помощи» и наконец — «Университетская МБАЛСП». За всё это время скульптурный портрет Пирогова на фасаде здания при входе ни разу не менялся. Теперь в МБАЛСМ «Н. И. Пирогов» трудятся 361 врач-ординатор, 150 научных сотрудников, 1025 медицинских специалистов и 882 работника вспомогательного персонала. Все они гордо называют себя «пироговцы». Больница считается одна из лучших в Болгарии, и в ней лечатся свыше 40 тыс. стационарных и 300 тыс. амбулаторных пациентов в год.[8]
14 октября 1977 года в Болгарии была напечатана почтовая марка «100 лет с прибытия академика Николая Пирогова в Болгарию».[9]
Памятник в Тарту — расположен в парке на холме Тоомемяги. Открыт в 1952 году (скульпторы: Й. Раудсепп, П. Тарвас, А. Вольберг, М. Мельдер)[10].
В честь Н. И. Пирогова названы улицы в Резине и Кишинёве.
Имя Николая Ивановича Пирогова носит специализированная больница (пол.Wojewódzki Specjalistyczny Szpital im. Mikołaja Pirogowa) в Лодзи.
По словам ректора РГМУ Николая Володина («Российская газета», 18 августа 2010 г.Архивная копия от 7 октября 2013 на Wayback Machine), это была «техническая ошибка бывшего руководства. Два года назад на заседании трудового коллектива было единогласно решено вернуть университету имя Пирогова. Но пока ничего не изменилось: устав, в который внесли изменения, до сих пор на утверждении… Он должен быть принят в ближайшее время». По состоянию на 4.11.2010, на сайте РГМУАрхивная копия от 8 октября 2014 на Wayback Machine университет описан как «им. Н. И. Пирогова», однако среди приведённых там нормативных документовАрхивная копия от 10 октября 2014 на Wayback Machine — по-прежнему устав 2003 года без упоминания имени Пирогова.
1977 (14 октомври). 100 г. от пребиваването на академик Николай Пирогов в България. Худ. Н. Ковачев. П. дълбок. Наз. Г 13. Листа (5х5). Н. И. Пирогов (руски хирург). 2703. 13 ст. Тираж: 150 000.