Institutul Pontifical Oriental este afiliat în plan academic Universității Pontificale Gregoriana (fondată în 1551), alături de Institutul Pontifical Biblic
Episcopi și Consiliul Pontifical al Laicilor . El a fost numit secretar al Congregației pentru Episcopi de către Ioan Paul al II-lea la 21 decembrie 1989;
de după Conciliul al II-lea din Vatican, rectifică această dublare și, drept urmare, în actualele ediții ale Anuarului pontifical nu mai apare decât unul