Alfacoronavirus

Alfacoronavirusurile (Alphacoronavirus) este un gen de coronavirusuri din subfamilia Orthocoronavirinae, familia Coronaviridae. Alfacoronavirusurile infectează numai mamiferele, printre acestea se numără coronavirusul canin, coronavirusurile feline (virusul peritonitei infecțioase feline și coronavirusul enteric felin), coronavirusurile porcine (coronavirusul respirator porcin, virusul gastroenteritei transmisibile a porcului, virusul diareei epidemice porcine, virusul sindromului diareii acute porcine), coronavirusurile umane (coronavirusul uman 229E și coronavirusul uman NL63) și mai multe coronavirusuri ale liliecilor. Alfacoronavirusurile erau încadrate mai înainte în "grupul 1" al coronavirusurilor.^[1][2][3][4]

Alphacoronavirus
Virusul gastroenteritei transmisibile (TGEV) văzut la microscopul electronic.
Clasificarea virusurilor
Grupă:	Grupa IV ((+)ssRNA)
Ordin:	Nidovirale
Familie:	Coronaviride
Subfamilie:	Orthocoronavirinae ( = Coronavirinae)
Gen:	Alphacoronavirus
Subgenuri
Colacovirus Decacovirus Duvinacovirus Luchacovirus Minacovirus Minunacovirus Myotacovirus Nyctacovirus Pedacovirus Rhinacovirus Setracovirus Soracovirus Sunacovirus Tegacovirus
Modifică text

Caracteristici distinctive

Virusurile din acest gen formează un grup monofiletic distinct în cadrul subfamiliei Orthocoronavirinae (= Coronavirinae). În afară de relația lor filogenetică relativ strânsă, singurele caracteristici generale care le deosebesc de alte coronavirusuri sunt:^[5]

• o structură unică a proteinei nestructurale nsp1, distinctă ca mărime și secvență de proteina nestructurală nsp1 a betacoronavirusurilor și fără un echivalent la gamacoronavirusuri
• prezența unei gene accesorii comune (denumită ORF3 la majoritatea speciilor de alfacoronavirus, ORF3b la virusul gastroenteritei transmisibile și 3c la coronavirusul felin/coronavirusul canin) care codifică o proteină membranară alfacoronavirală multipas (αmp) accesorie. În timp ce unele alfacoronavirusuri au o singura proteină accesorie αmp, altele pot avea până la cel puțin șase gene accesorii, de ex., coronavirusul canin.

Clasificarea

Genul Alphacoronavirus include 14 subgenuri (Colacovirus, Decacovirus, Duvinacovirus, Luchacovirus, Minacovirus, Minunacovirus, Myotacovirus, Nyctacovirus, Pedacovirus, Rhinacovirus, Setracovirus, Soracovirus, Sunacovirus, Tegacovirus) și 19 specii cu mai multe tulpini. Un număr mare de alfacoronavirusuri nu sunt încă clasificate.^[6][7]

Referințe

1. Elvira Sînziana Ciufescu. Virusologie medicală. Editura Medicală Națională. 2003
2. Costin Cernescu. Virusologie medicală. Editura Medicală. 2012
3. G. Zarnea, O.V. Popescu. Dicționar de microbiologie generală și biologie moleculară. Editura Academiei Române, București, 2011
4. Radu Moga Mânzat. Boli virotice și prionice ale animalelor. Timișoara: Brumar, 2005
5. ICTV, International Committee on Taxonomy of Viruses. (2012). Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: Ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Edited by A. M. Q. King et al. Elsevier Academic Press.
6. NCBI taxonomy database
7. „International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) 2019 taxonomy release”. Arhivat din original la 20 martie 2020. Accesat în 16 martie 2021.