O Condado de Palo Alto é um dos 99 condados do estado norte-americano de Iowa. A sede do condado é Emmetsburg, que é também a sua maior cidade. O condado tem uma área de 1475 km², uma população de 10 147 habitantes, e uma densidade populacional de 7 hab/km². O condado foi fundado em 1847 e o seu nome provém da batalha de Palo Alto a primeira da guerra Mexicano-Americana.