Rede filogenética

Uma rede filogenética é qualquer gráfico usado para visualizar relações evolutivas entre espécies ou organismos (tanto abstracta como explícitamente),^[1] entre sequência de nucleotídeos, genes, cromossomas, genomas ou espécies.^[2] São usadas quando se acredita que eventos reticulados tais como hibridação, transferência horizontal de genes, recombinação ou duplicação génica estão envolvidos.^[3] As árvores filogenéticas são um subconjunto das redes filogenéticas. Redes filogenéticas podem ser inferidas e visualizadas usando software como Splitstree, Network ou TCS.^[4][5][6]

Referências

1. Huson DH, Scornavacca C (2011). «A survey of combinatorial methods for phylogenetic networks». Genome Biology and Evolution. 3: 23–35. PMC 3017387. PMID 21081312. doi:10.1093/gbe/evq077
2. Huson DH, Rupp R, Scornavacca C (2010). Phylogenetic Networks. Cambridge University Press: [s.n.] Consultado em 23 de março de 2010. Cópia arquivada em 14 de julho de 2014
3. Arenas M, Valiente G, Posada D (December 2008). «Characterization of reticulate networks based on the coalescent with recombination». Molecular Biology and Evolution. 25 (12): 2517–20. PMC 2582979. PMID 18927089. doi:10.1093/molbev/msn219 Verifique data em: |data= (ajuda)
4. Huson DH, Bryant D (February 2006). «Application of phylogenetic networks in evolutionary studies». Molecular Biology and Evolution. 23 (2): 254–67. PMID 16221896. doi:10.1093/molbev/msj030 Verifique data em: |data= (ajuda)
5. Schliep K, Potts AJ, Morrison DA, Grimm GW (2017). «Intertwining phylogenetic trees and networks». Methods in Ecology and Evolution. 8 (10): 1212–1220. doi:10.1111/2041-210X.12760
6. Schliep KP (2018). «R package: Estimating phylogenetic trees with phangorn.» (PDF)

Referências

• D. H. Huson and D. Bryant, Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies, Mol. Biol. Evol., 23(2):254-267, 2006.|