Métodos comparativos filogenéticos

Métodos comparativos filogenéticos (abreviados na literatura como PCMs, do inglês phylogenetic comparative methods) usa informações sobre as relações históricas das linhagens (filogenias) para testar hipóteses evolutivas. O método comparativo tem uma longa história em biologia evolutiva; de fato, Charles Darwin usou as diferenças e semelhanças entre as espécies como uma importante fonte de evidência em A Origem das Espécies. No entanto, o fato de que linhagens estreitamente relacionadas compartilham muitas características e combinações de características como resultado do processo de descendência com modificação significa que as linhagens não são independentes. Essa percepção inspirou o desenvolvimento de métodos comparativos explicitamente filogenéticos.^[1] Inicialmente, esses métodos foram desenvolvidos principalmente para controlar a história filogenética ao testar adaptação;^[2] no entanto, nos últimos anos, o uso do termo foi ampliado para incluir qualquer uso de filogenias em testes estatísticos.^[3] Embora a maioria dos estudos que empregam PCMs se concentrem nos organismos existentes, muitos métodos também podem ser aplicados a táxons extintos e podem incorporar informações do registro fóssil.^[4]

PCMs geralmente podem ser divididos em dois tipos de abordagens: aquelas que inferem a história evolutiva de algum caráter (fenotípico ou genético) através de uma filogenia e aqueles que inferem o processo de ramificação evolutiva em si (taxas de diversificação), embora existam algumas abordagens que fazem ambos simultaneamente.^[5] Tipicamente, a árvore que é usada em conjunto com as PCMs foi estimada independentemente (ver filogenética computacional) de modo que ambas as relações entre as linhagens e o comprimento dos ramos que as separam são assumidas como sendo conhecidas.

Referências

1. Felsenstein, Joseph (janeiro de 1985). «Phylogenies and the Comparative Method». The American Naturalist. 125 (1). 1 páginas. doi:10.1086/284325
2. Harvey, Paul H.; Pagel, Mark D. (1991). The Comparative Method in Evolutionary Biology. Oxford: Oxford University Press. 248 páginas. ISBN 9780198546405
3. O'Meara, Brian C. (dezembro de 2012). «Evolutionary Inferences from Phylogenies: A Review of Methods». Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics. 43 (1): 267–285. doi:10.1146/annurev-ecolsys-110411-160331
4. Pennell, Matthew W.; Harmon, Luke J. (junho de 2013). «An integrative view of phylogenetic comparative methods: connections to population genetics, community ecology, and paleobiology». Annals of the New York Academy of Sciences. 1289 (1): 90–105. PMID 23773094. doi:10.1111/nyas.12157
5. Maddison, Wayne; Midford, Peter; Otto, Sarah (outubro de 2007). «Estimating a Binary Character's Effect on Speciation and Extinction». Systematic Biology. 56 (5): 701–710. PMID 17849325. doi:10.1080/10635150701607033