Anotação de DNA
Da Wikipédia, a enciclopédia livre
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Em biologia molecular e genética, anotação de DNA ou anotação de genoma é o processo de descrever a estrutura e função dos componentes de um genoma, [2] analisando-os e interpretando-os a fim de extrair seu significado biológico e compreender os processos biológicos dos quais eles participam. [3] Entre outras coisas, identifica a localização dos genes e todas as regiões codificantes de um genoma e determina o que esses genes fazem. [4]
A anotação é realizada após um genoma ser sequenciado e montado, e é uma etapa necessária na análise do genoma antes que a sequência seja depositada em um banco de dados e descrita em um artigo publicado. Embora a descrição de genes individuais e seus produtos ou funções seja suficiente para considerar esta descrição como uma anotação, a profundidade da análise relatada na literatura para diferentes genomas varia amplamente, com alguns relatórios incluindo informações adicionais que vão além de uma simples anotação. [5] Além disso, devido ao tamanho e complexidade dos genomas sequenciados, a anotação do DNA não é realizada manualmente, mas sim automatizada por meios computacionais. No entanto, as conclusões tiradas dos resultados obtidos requerem uma análise pericial manual. [6]
A anotação de DNA é classificada em duas categorias: anotação estrutural, que identifica e demarca elementos em um genoma, e anotação funcional, que atribui funções a esses elementos. [7] Esta não é a única forma como a anotação foi categorizada, pois várias alternativas, como classificações baseadas em dimensões [8] e classificações baseadas em níveis [3] também foram propostas.
A anotação estrutural descreve a localização precisa dos diferentes elementos em um genoma, como quadros de leitura abertos, regiões de codificação, éxons, íntrons, repetições, locais de splicing, sequências regulatórias, códons de início e parada e promotores. [6] [9]
A anotação funcional atribui funções aos elementos genômicos encontrados pela anotação estrutural, [7] relacionando-os a processos biológicos como o ciclo celular, morte celular, desenvolvimento, metabolismo, etc. identificando elementos que possam ter sido anotados por erro. [2]
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