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Johann Jakob Bernhardi (Erfurt, 1 de setembro de 1774 - Erfurt, 13 de maio de 1850) foi um médico e botânico alemão[1].
Johann J. Bernhardi estudou medicina e botânica na Universidade de Erfurt e exerceu a profissão de médico durante algum tempo na sua terra natal.
Ingressou na Universidade de Erfurt como professor de botânica e diretor do Jardim botânico, cargo que exerceu até a sua morte em 1850, quando foi enterrado na avenida central deste jardim.
Ao longo de sua vida, graças a aquisições e trocas com outros botânicos, desenvolveu na Alemanha do século XVIII e século XIX um enorme herbário de aproximadamente 60.000 plantas, com espécimes da América do Norte, da América do Sul, da Ásia e da África.
Este herbário não permaneceu na Alemanha. Em 1857, após a morte de Bernhardi, foi comprado por Henry Shaw, fundador do Jardim Botânico de Missouri nos Estados Unidos pelo preço de 600 dólares. Este herbário foi o núcleo da coleção inicial deste museu, atualmente conhecido por "Missouri Botanical Garden herbarium", que agora apresenta um acervo de aproximadamente 5 milhões de espécimes e uma biblioteca com mais de 120.000 volumes.
Bernhardi estudou e descreveu várias espécies de orquídeas que levam a sua abreviatura no nome específico, entre elas a Epipactis atrorubens.
Também descreveu uma espécie de rosa sem espinhos, "Rosa x francofurtana", que encontrou no jardim da casa de Johann Wolfgang von Goethe, em Weimar.
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