Dziura w Organach II – jaskinia, a właściwie schronisko, w Dolinie Kościeliskiej w Tatrach Zachodnich. Wejście do niej znajduje się w południowej części Organów, w ścianie znajdującego się tam skalnego amfiteatru, w pobliżu Dziury w Organach I i Dziury w Organach IV, na wysokości 1410 metrów n.p.m. Jaskinia jest pozioma, a jej długość wynosi 5 metrów.