Malegaon er en by og et kommunestyre i distriktet Nashik i den indiske delstaten Maharashtra. Malegaon er administrativt hovedkvarter for en tehsil med samme navn som byen. Byen ligger omtrent 280 km nordøst for storbyen Mumbai og ca. 100 km nordøst for Nashik. Malegaon ligger ved samløpet mellom elvene Girna og Mosam, i en gjennomsnittlig høyde på 438 moh.. Malegaon er en av de største byene i det nordvestre Maharashtra. Det er den nest største byen i Nashik-distriktet etter Nashik. Byen ligger på National Highway 3 som forbinder Mumbai til Agra.