Holmefjorden er en fjord i Herøy kommune på Sunnmøre. Navnet blir benyttet om det sjøområdet som ligger mellom øyene Nerlandsøya, Bergsøya, Leinøya og Remøya. Holmefjorden er delvis vernet mot Norskehavet av holmene i Breidsundet, som også har gitt fjorden sitt navn. Fjorden har en lengde på fem kilometer fra nordvest til sørøst. På det dypeste er fjorden 90 meter.