Farallon-øyene er en gruppe øyer og sjøstaurer i Farallonesgolfen utenfor kysten av San Francisco i California. De ligger 48 km vest for Golden Gate og 20 km sør for Point Reyes, og er synlige fra fastlandet på klarværsdager. Øyene er administrativt del av byfylket San Francisco. Den eneste bebodde delen av Farallon-øyene er på Southeast Farallon Island, hvor forskere fra Point Blue Conservation Science og U.S. Fish and Wildlife Service holder til.