Amper er en elv sør i Bayern i Tyskland og en av de største sideelvene til Isar fra venstre, som renner gjennom München. Etter en lengde på 185 kilometer munner den ut i Isar ved Moosburg. Elven har sitt utspring fra Ammersee og den øvre grenen ovenfor Ammersee blir kalt Ammer. Byer langs Amper er Fürstenfeldbruck, Dachau og Moosburg. De største sideelvene er for øvrig Glonn, Würm og Maisach.