Taksonomien til storkreps er komplisert og under stadig revisjon. Det er generelt omstridt å fin-inndele organismer taksonomisk. En moderne oppdatering av systematikken gis av Martin og Davis[1], som følgende oversikt følger ned til nivået orden, mens lavere nivåer i enkelte tilfeller følger Catalogue of Life[2], men stort sett WoRMS-databasen.[3].
- Rekke: krepsdyr (Crustacea) - 67.000 arter
- KLASSE storkrepser (Malacostraca) - +30.000 arter Latreille, 1802
- Underklasse Eumalacostraca - +22.+++ arter Grobben, 1892
- Usikker overorden Eucarida Calman, 1904
- Orden tifotkrepser (Decapoda) - 2.700 slekter, 15.000 arter Latreille, 1802
- Usikker underorden Natantia (2013: direkte under Decapoda)
- Underorden «reker» (Dendrobranchiata) Spence Bate, 1888
- Underorden kreps og krabber Reptantia = Macrura Reptantia
- Usikker underorden eggbærereker, Pleocyemata
- Infraorden (Anomura)
- Overfamilie Aegloidea Dana, 1852
- Overfamilie Chirostyloidea Ortmann, 1892 = Kiwaoidea Macpherson, Jones & Segonzac, 2005
- Overfamilie Galatheoidea Samouelle, 1819
- Usikker overfamilie Hippoidea Latreille, 1825
- Overfamilie Lithodoidea Samouelle, 1819
- Overfamilie Lomisoidea Bouvier, 1895
- Overfamilie Paguroidea Latreille, 1802 = Birgusoidea / Cancellochelloidea / Cheiroplatoidea / Pomatocheloidea / Pylocheloidea Watabe, 2007
- Infraorden Axiidea de Saint Laurent 1979
- 2013: Overfamilie Axioidea Huxley, 1879
- Familie Axiidae Huxley, 1879 = Calocarididae Ortmann, 1891 = Eiconaxiidae Sakai & Ohta, 2005 = Eiconaxiopsididae Sakai, 2011
- Familie Callianassidae Dana, 1852 = Ctenochelinae Manning & Felder, 1991
- Familie Callianideidae Kossman, 1880
- Familie Micheleidae Sakai, 1992
- Familie Strahlaxiidae Poore, 1994
- Familie Thomassiniidae de Saint Laurent, 1979
- Infraorden krabber (Brachyura)
- Seksjon incertae sedis: - 54 slekter
- Seksjon Eubrachyura
- Underseksjon Heterotremata
- Overfamilie Aethroidea Dana, 1851
- Overfamilie Bythograeoidea Williams, 1980
- Overfamilie Calappoidea De Haan, 1833
- Overfamilie Cancroidea Latreille, 1802
- Overfamilie Carpilioidea Ortmann, 1893
- Overfamilie Cheiragonoidea Ortmann, 1893
- Overfamilie Corystoidea Samouelle, 1819
- Overfamilie Dairoidea Serène, 1965
- Overfamilie Dorippoidea MacLeay, 1838
- Overfamilie Eriphioidea MacLeay, 1838
- Overfamilie Gecarcinucoide a Rathbun, 1904
- Overfamilie Goneplacoidea MacLeay, 1838
- Overfamilie Hexapodoidea Miers, 1886
- Usikker overfamilie Hymenosomatoidea MacLeay, 1838
- Overfamilie Leucosioidea Samouelle, 1819
- Overfamilie Majoidea Samouelle, 1819
- Overfamilie Orithyioide a Dana, 1852
- Overfamilie Palicoidea Bouvier, 1898
- Overfamilie Parthenopoidea MacLeay, 1838
- Overfamilie Pilumnoidea Samouelle, 1819
- Overfamilie Portunoidea Rafinesque, 1815
- Overfamilie Potamoidea Ortmann, 1896
- Overfamilie Pseudothelphusoidea Ortmann, 1893
- Overfamilie Pseudozioidea Alcock, 1898
- Overfamilie Retroplumoidea Gill, 1894
- Overfamilie Thioidea H. Milne Edwards, 1853
- Overfamilie Trapezioidea Miers, 1886
- Overfamilie Trichodactyloidea H. Milne-Edwards, 1853
- Overfamilie Trichopeltarioidea Tavares & Cleva, 2010
- Overfamilie Xanthoidea MacLeay, 1838
- Usikker underseksjon Raninoida
- Underseksjon Thoracotremata
- Overfamilie Cryptochiroidea Paul'son, 1875
- Overfamilie Grapsoidea MacLeay, 1838
- Overfamilie Ocypodoidea Rafinesque, 1815
- Overfamilie Pinnotheroidea De Haan, 1833
- Seksjon Podotremata
- Overfamilie Cyclodorippoidea Ortmann, 1892
- Overfamilie Dromioidea De Haan, 1833 = Dromiacea
- Overfamilie Homolodromioidea Alcock, 1899
- Overfamilie Raninoidea De Haan, 1839
- Infraorden reker (Caridea) Dana, 1852
- Overfamilie Alpheoidea Rafinesque, 1815
- Overfamilie Atyoidea De Haan, 1849
- Overfamilie Bresilioidea Calman, 1896
- Overfamilie Campylonotoidea Sollaud, 1913
- Overfamilie Crangonoidea Haworth, 1825
- Overfamilie Nematocarcinoidea Smith, 1884
- Overfamilie Oplophoroidea Dana, 1852a
- Overfamilie Palaemonoidea Rafinesque, 1815
- Overfamilie Pandaloidea Haworth, 1825
- Overfamilie Pasiphaeoidea Dana, 1852
- Overfamilie Physetocaridoidea Chace, 1940
- Overfamilie Processoidea Ortmann, 1896a
- Overfamilie Psalidopodoidea Wood-Mason, 1892
- Overfamilie Stylodactyloidea Spence Bate, 1888
- Infraorden Gebiidea de Saint Laurent, 1979
- Familie Axianassidae Schmitt, 1924
- Familie Laomediidae Borradaile, 1903
- Familie Thalassinidae Latreille, 1831
- Familie Upogebiidae Borradaile, 1903 = Gebiadae Haworth, 1825
- Infraorden Procarididea
- Familie Procarididae Chace & Manning, 1972
- Infraorden pussereker, korallreker (Stenopodidea) Bate, 1888
- Familie Macromaxillocarididae Alvarez, Iliffe & Villalobos, 2006
- Familie Spongicolidae Schram, 1986
- Familie Stenopodidae Claus, 1872
- Tidligere infraorden languster (Palinura)
- 2013: Inngår i infraordenene Ploychelida og Achelata i ordenen Reptantia
- Overfamilie Eryonoidea De Haan, 1841 = Eryonoidea
- Familie Eryonidae De Haan, 1841
- Tidligere infraorden gravekreps (Thalassinidea) Latreille, 1831
- 2013: Inngår i infraordenene Axiidea og Gebiidea
- Usikker overfamilie Axioidea Huxley, 1879 = Axiidea
- Usikker overfamilie Callianassoidea Dana, 1852 = Callianassidae Dana, 1852
- Familie Gourretiidae Sakai, 1999 = Gourretiinae Sakai, 1999
- Usikker overfamilie Thalassinoidea Latreille, 1831 = Thalassinidae Latreille, 1831
