Het Ortameer ligt in de Piëmontese provincies Novara en Verbano-Cusio-Ossola. De waterspiegel van het meer ligt 290 meter boven zeeniveau. Water verlaat het meer via de korte rivier de Nigoglia die al na enkele honderden meters samenvloeit met de Strona. Deze stroomt op zijn beurt weer uit in het Lago Maggiore. Het Ortameer is het enige grote Noord-Italiaanse meer waarvan het water aan de noordzijde uitvloeit.