Mouilleron-Saint-Germain is een gemeente in het Franse departement Vendée en telt 1.816 inwoners (2016). De plaats maakt deel uit van het arrondissement Fontenay-le-Comte. De gemeente ontstond op 1 januari 2016 door de samenvoeging van de voormalige gemeentes Mouilleron-en-Pareds en Saint-Germain-l'Aiguiller.