Behalve zijn beroepsmatige werkzaamheden als historicus zette hij zich actief in voor de mensenrechten en keerde hij zich daarom tegen het optreden van Frankrijk in de Algerijnse Onafhankelijkheidsoorlog.
Met andere bekende intellectuelen zoals Michel Foucault en Jean-Marie Domenach tekende hij op 8 februari1971 het manifest van de Groupe d'information sur les prisons. Ook bij diverse andere vredesorganisaties was hij betrokken.
In juli 2003 nam hij deel aan een oproep van Une autre voix juive (de Franse tegenhanger van de Joods-Nederlandse organisatie Een Ander Joods Geluid) waarin diverse Franse Joden hun solidariteit met de Palestijnen betuigden.
Pierre Vidal-Naquet overleed enkele dagen na zijn 76-ste verjaardag.
1972Économies et sociétés en Grèce ancienne. Périodes archaïque et classique, met Michel Austin, Armand Colin
1984Flavius Arrien entre deux mondes, analyse à la suite de la traduction par Pierre Savinel de l' Histoire d'Alexandre d'Arrien, Éditions de Minuit, coll. Arguments
1988Du bon usage de la trahison, inleiding bij vertaling door Pierre Savinel van De joodse oorlogen van Flavius Josephus, Éditions de Minuit, coll. Arguments
1990La Grèce ancienne - Du mythe à la raison, met Jean-Pierre Vernant, Le Seuil, coll. Points
1991La Grèce ancienne - L'espace et le temps, met Jean-Pierre Vernant, Le Seuil, coll. Points
1991Le chasseur noir - Formes de pensées et formes de société dans le monde grec, La Découverte
1992La Grèce ancienne - Rites de passage et transgressions, met Jean-Pierre Vernant, Le Seuil, coll. Points
2000Mythe et tragédie en Grèce ancienne, met Jean-Pierre Vernant, La Découverte
2000Les Grecs, les historiens et la démocratie, La Découverte
2001Œdipe et ses mythes, met Jean-Pierre Vernant, Complexe