국립해양유산연구소(國立海洋遺産硏究所, National Research Institute of Maritime Cultural Heritage)는 해양유물의 조사·연구·보존 및 전시에 관한 사무를 관장하는 대한민국 국가유산청의 소속기관이다. 2009년 4월 6일 발족하였으며, 전라남도 목포시 남농로 136에 위치하고 있다. 소장은 고위공무원단 나등급에 속하는 임기제공무원으로 보한다.