과학기술혁신본부(科學技術革新本部)는 과학기술정책 총괄, 국가연구개발사업 예산 심의·조정 및 성과평가 기능을 수행하는 대한민국 과학기술정보통신부의 하부조직이다. 경기도 과천시 관문로 47 정부과천청사 5동에 위치하며, 본부장은 차관급 정무직공무원으로 보한다.