WNT9B
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の脊椎動物で、WNT3A遺伝子はWNT9A（英語版）遺伝子とゲノム上で並んで位置している。同様に、WNT3遺伝子はWNT9B（英語版）遺伝子と並んで位置している。WNT9AとWNT9Bはβ-カテニン/Tcf経路を介してシグナルを伝達するが、WNT3AとWNT3のように同じ細胞過程に関係した役割を果たしているわけではない。
Wntシグナル経路
WNT6（英語版）, WNT7A（英語版）, WNT7B（英語版）, WNT8A（英語版）, WNT8B（英語版）, WNT9A（英語版）, WNT9B（英語版）, WNT10A（英語版）, WNT10B（英語版）, WNT11（英語版）, WNT16（英語版） マウスMus musculus (ヒトと同一)