集団遺伝学（しゅうだんいでんがく、英語: population genetics）は、生物集団内における遺伝子の構成・頻度の変化に関する遺伝学の一分野。 チャールズ・ダーウィンの自然選択説とグレゴール・ヨハン・メンデルの遺伝法則の融合から誕生した分野と呼ぶこともできる。

Principles of population genetics (Vol. 116). Sunderland, MA: Sinauer associates. ^ Hill, W. G. (2014). Applications of population genetics to animal breeding

Agenda of Population Genetics. Reviews in American History, 16(1), 79-84. doi:10.2307/2702068 ^ Ewens, W. J. (2012). Mathematical population genetics 1: theoretical

R. Chakraborty (eds.), Genomic Diversity: applications in human population genetics (1999), pp. 91–101. ^ L. Quintana-Murci et al., Y-Chromosome lineages

Mustavich, et al., "Pinghua population as an exception of Han Chinese’s coherent genetic structure." Journal of Human Genetics (2008) 53:303–313. doi:10