縁なトミストマ亜科が全てインドガビアル科に位置付けられ、それに伴ってマチカネワニもその系統的位置の解釈が変更された。2018年には Lee と Yates により形態情報・分子情報・層序を用いた系統解析が発表され、トミストマ亜科は側系統群であることが示唆された。ここでもマチカネワニはインドガビアル科に位置付けられている。
Hist Med Vet 29 (2): 35-41. PMID 15376360. ^ a b Deem SL, Spelman LH, Yates RA, Montali RJ (2000). “Canine distemper in terrestrial carnivores: a review”