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生体機能代行装置学(せいたいきのうだいこうそうちがく)とは、医学と工学のそれぞれの進歩が結びついた結果生まれた治療用ME機器の中で、とくに臨床工学技士と関係の深い体外循環装置(人工心肺装置)、呼吸療法装置(人工呼吸器)、人工腎臓装置などについて扱う学問分野である。
上記の臓器はそれぞれが生命維持に重要な機能を代行する装置、つまり生体機能代行装置であり、それらの目的とする機能を完全かつ安全に操作運用することが臨床工学技士に要求される。
生体機能代行装置は現代医療においてルーティンの一部として用いられるものであり、その操作には専門知識が必要になる。
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