La città di San Juan Chamula è a capo del comune di Chamula, nello stato del Chiapas, Messico. Conta 2.959 abitanti secondo le stime del censimento del 2005 e le sue coordinate sono 16°47'N 92°41'W. Dal 1983, in seguito alla divisione del Sistema de Planeación, è ubicata nella regione economica II: ALTOS. È situata 10 km a nord di San Cristóbal de las Casas, a 2.200 m di altezza.