RNA פולימראז II

RNA פולימראז II הוא אנזים הנמצא בתאים אֵיקַרְיוֹטִיים. הוא מזרז שעתוק של DNA ל־mRNA, snRNA ו-microRNA ראשוניים. לרוב האורגניזמים יש 12 תתי-יחידות של RNA פולימראז II, עם מסה של 550 kDa.‏^[1] RNA פולימראז II הוא הסוג הנחקר ביותר של RNA פולימראז. מספר רב של גורמי שעתוק דרוש לקישור לפרומוטורים ולתחילת השעתוק.

RNA פולימראז II בשמר האפייה בקומפלקס עם אלפא אמניטין (באדום). המגנזיום באתר הפעיל מסומן בוורוד. העיגולים האפורים הם יוני אבץ.

תת-יחידות

• RPB1 - היחידה הגדולה ביותר של האנזים. באדם מקודד על ידי הגן POLR2A. הוא חיוני לתפקודו של הפולימראז. יחד עם יחידות פולימראז נוספות, הוא יוצר את המתחם קושר ה-DNA של הפולימראז, תעלה שבה ה-DNA משועתק לרנ"א.
• RPB2 - היחידה השנייה בגודלה שבשיתוף עם שתי יחידות פולימראז אחרות יוצרת מבנה בתוך הפולימראז השומר על הקשר בין ה-DNA לבין ה-RNA המסונתז באתר הפעיל של האנזים.
• RPB3 - תת-היחידה השלישית בגודלה. מתקיימת כהטרודימר עם יחידת פולימראז נוספת. באינטראקציה עם RPB1-5,7,10-12.
• RPB4 - מקודד על ידי POLR2D. תת-היחידה הרביעית בגודלה וייתכן ויש לה תפקיד בהגנה מפני עקה.
• RPB5 - באדם מקודד על ידי POLR2E. שתי מולקולות של תת-היחידה נמצאות בכל RNA פולימראז II. נמצא באינטראקציה עם RPB1,3,6.
• RPB6 - יוצר מבנה עם לפחות שתי תת-יחידות נוספות שמייצב את הפולימראז על ה-DNA.
• RPB7 - מקודד על ידי POLR2G וייתכן ויש לו תפקיד בבקרה על פעילות הפולימראז
• RPB8 - נמצא באינטראקציה עם תת-יחידות RPB1-3,5,7.
• RPB9 - התעלה שבה ה-DNA משועתק ל-RNA; בנוי מ-RPB9 ו-RPB1.
• RPB10 - תוצר של הגן POLR2L. באינטראקציה עם RPB1-3, 5 ו-RPB3.
• RPB11 - בנוי משלוש תת-יחידות באדם.
• RPB12 - מגיב עם RPB3.

CTD

ב-RNA פולימראז נמצא מתחם קצה C ‏(C-terminal domain; CTD) - חלק זה אחראי על תחילת השעתוק, על תהליך ה-capping בקצה ה-5' וקישור של ספלייסוזום עבור שחבור. הרצף מורכב לרוב מעד 52 רצפים חוזרים של חומצות האמינו Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser. ה-CTD הוא נקודת השקה בין מערכת השעתוק למערכת עיבוד ה-RNA - כאשר הודות למודיפקיציות זרחון שונות שלו מסוגלים להיקשר אליו פקטורים שונים המעורבים בתהליכי עיבוד RNA.

קישורים חיצוניים

מדיה וקבצים בנושא RNA פולימראז II בוויקישיתוף

הערות שוליים

1. J. Parker, RNA Polymerase, in Encyclopedia of Genetics, 2001