2006 ברוסיה הייתה השנה ה-15 להקמת המדינה לאחר פירוק ברית המועצות.
- 1 בינואר - רוסיה מנתקת את הזרמת הגז הטבעי לאוקראינה בשל סכסוך מחירים.
- 9 במרץ - חלק מאחת המנהרות של הרכבת התחתית של מוסקבה מתמוטט ונופל על רכבת וגורם לשרפה ברכבת. איש לא נפגע באירוע.
- 10 ביולי - מנהיג המורדים הצ'צ'ני שאמיל בסאייב מחוסל על ידי צבא רוסיה.
- 8 באוגוסט – בבוינאקסק (דאגסטן) בעת נסיעתו של התובע הכללי של העיר בוינאקסק ביטאר ביטארוב התפוצצו כמה רכבי תופת. ביטארוב שנפצע קשה אושפז ומת לאחר מכן מפצעיו. שעה לאחר הפיצוץ הגיע ממחצ'קלה שר הפנים של דאגסטן, אדילגריי מגומדטאגירוב. השר שהגיע בדרך חלופית מזו הראשית שבה עבר התובע הכללי העירוני, עבר אף הוא סמוך לרכבי תופת נוספים שהתפוצצו, אך כיוון ששהה ברכב משוריין לא ספג פגיעה. שניים מהשוטרים שליוו אותו נהרגו, אחד נוסף נפצע. המחבלים הצליחו להימלט.
- 21 באוגוסט – פיגוע על רקע לאומני בשוק צ'רקיזובו במוסקבה (השוק הגדול ביותר באירופה). כתוצאה מהפיצוץ 14 איש נהרגו, 61 נפצעו.
- 22 באוגוסט - טיסה 612 של פולקובו איירליינס מתרסקת באוקראינה בקרבת הגבול הרוסי באירוע נהרגו 171 בני אדם, בהם 45 ילדים.
- 25 בספטמבר - שייריה של דאגמאר, נסיכת דנמרק, אמו של הצאר האחרון של רוסיה ניקולאי השני, מועברים מקתדרלת רוסקילדה לסנט פטרסבורג לקבורה בסנקט פטרבורג, לפי בקשתה להקבר לצד בעלה האהוב.
- 28 בספטמבר - טקס הקבורה של דאגמאר, נסיכת דנמרק בקתדרלת פיוטר ופאבל שבסנט פטרסבורג, 78 שנים לאחר מותה.
- 7 באוקטובר - העיתונאית ופעילת זכויות האדם הרוסיה אנה פוליטקובסקיה, אשר נודעה עקב התנגדותה למלחמת צ'צ'ניה השנייה ולמדיניות של הנשיא הרוסי ולדימיר פוטין, נרצחת במוסקבה מירי בראשה.
- 10 באוקטובר - מדענים אמריקנים ורוסים הצהירו על הגילוי של יסוד כימי חדש - אוגאנסון.
- 28 באוקטובר - הוקמה מפלגת רוסיה הוגנת ממיזוגן של תנועת "מולדת", המפלגה הרוסית לחיים ומפלגת הגמלאים הרוסית.
- 23 בנובמבר - סוכן הביון הרוסי לשעבר אשר התנגד למשטר של נשיא רוסיה ולדימיר פוטין, אלכסנדר ליטוויננקו, נפטר בלונדון כתוצאה מהרעלה מסתורית. במכתב האחרון שכתב לפני מותו האשים ליטוויננקו את פוטין בהרעלתו.