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La respiration aérobie est un mode de respiration utilisant l'oxygène comme comburant.
Lors de la glycolyse, le cycle de Krebs, la bêta-oxydation et les autres processus de dégradation des biomolécules, il y a production de coenzymes réduits (notamment NADH).
Les électrons de ces coenzymes passent sur une chaîne de transporteurs. Dans le cas d'une respiration aérobie, l'accepteur final est l'oxygène.
Pour simplifier (en détail dans l'article consacré à la chaîne respiratoire) :
Cette voie est beaucoup plus courte en transporteur d'électrons, il y a production d'eau oxygénée.
Cette voie est peu énergétique. Aussi, une bactérie possédant une telle voie sans posséder de catalase est anaérobie stricte car l'oxygène induirait la production d'eau oxygénée toxique.
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