Les Idées morales des hétérodoxes latins au début du XIIIesiècle, Paris, 1903 (Bibliothèque de l’École pratique des hautes études, sciences religieuses, XVI, 1).
La Chrétienté et l’idée de croisade, 2 vols., Paris, 1954-1959 (L’Évolution de l’humanité, 38 et 38 bis). Texte établi par Alphonse Dupront. Réédition avec une postface de Michel Balard: La Chrétienté et l’idée de croisade, Paris, 1995.
«De quelques faits de prophétisme dans des sectes latines antérieures au joachimisme», Revue de l’histoire des religions 52 (1905), p.177-218.
«Mahomet-Antichrist dans le Moyen Âge latin», Mélanges Hartwig Derenbourg (1844-1908). Recueil de travaux d’érudition dédiés à la mémoire d’Hartwig Derenbourg par ses amis et ses élèves, Paris, 1909, p.261-277.
«Notes sur le messianisme médiéval latin (XIe – XIIesiècle)», École pratique des hautes études, Section des sciences religieuses. Annuaire 1912, Paris, 1912, p.1-29.
«Saint François et l’épopée française», Annales du musée Guimet, 38, 1912, p.59-98.
«Les Croisades d’enfants», Revue de l’histoire des religions 73 (1916), p.259-282.
«L’Ordalie et la prophétie comminatoire», Actes du congrès international d’histoire des religions tenu à Paris en , Paris, 1925, II, p.376-381.
«Le Gnosticisme dans les sectes médiévales latines», Revue d’histoire et de philosophie religieuses 7 (1927), p.395-411.
Paul Alphandéry (1875-1932) inÉcole pratique des hautes études, Section des sciences religieuses. Annuaire 1932-1933. 1931. pp. 28-31. [lire en ligne].
