Jean-Blaise Djian travaille d'abord comme compositeur de musique et exerce divers métiers alimentaires avant de rencontrer Régis Loisel en 1987. Ce dernier lui enseigne les rudiments du métier de scénariste de bande dessinée. En 1988 tous deux coécrivent un scénario de quatre pages pour l'album collectif Le Retour de la Bande à Renaud, publié chez Delcourt.
Il est, avec sept autres auteurs et dessinateurs de bande dessinée, membre du comité artistique du festival Des Planches et des Vaches. À l'occasion du dixième anniversaire de ce festival, en , il a reçu un prix spécial pour l'ensemble de son œuvre en présence d'une dizaines d'artistes avec qui il collabore, notamment Régis Loisel.
D'origine arménienne, Jean-Blaise Djian, épaulé par Jan Varoujan Sirapian, scénarise l'album Mission spéciale, Némésis (dessin de Paolo Cossi) qui parait en 2014 chez l'éditeur Sigest[1]. La BD traite de l'opération Némésis, une opération menée entre 1920 et 1922 par des Arméniens pour exécuter plusieurs responsables du génocide arménien ou des massacres d'Arméniens à Bakou.
Djian est également le co-scénariste de l'album Varto (avec le concours du scénariste Gorune Aprikian et du dessinateur Stéphane Torossian), paru en 2015 chez Steinkis[2] dont l'histoire relate un épisode fictif du génocide des Arméniens.
Adèle et Caïn, avec Alain Zibel (dessins), Emmanuel Proust éditions, 2005.
L'Affaire Bassière, avec Jérémy Lambert (dessins), CG Orne, 2007.
Le Capitaine Fracasse, avec Bruno Marivain (coscénariste) et Philippe Chanoinat (dessins), Éditions Adonis, 2008.
Agaguk, avec Yvon Roy (dessins) et d'après le roman d'Yves Thériault, Éditions Adonis, collection Romans de toujours[25],[26], 2008. Réédition en 2011 dans la collection Les Indispensables de la littérature en BD chez Glénat.
199 Combats, avec Nicolas Brachet (dessins) et Maurice Papazian (coscénariste), Éditions Emmanuel Proust, 2008.
Normandie June 44 Omaha Beach, pointe du Hoc, avec Alain Paillou, Éditions Vagabondages, 2008.
Le Livre de la jungle, avec TieKo (dessins), Éditions Glénat coll.«Grafica», 2010.