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Le qualificatif acidophile (ne pas confondre avec acidiphile, voir ci-dessous) s'applique à des organismes ne pouvant survivre et se multiplier que dans des environnements acides (pH faible) ou très acides. Plusieurs d'entre eux se dégradent dans un pH supérieur à 4. Ce sont des organismes extrêmophiles-vrais. (On englobe parfois improprement sous le vocable acidophile des organismes qui supportent une acidité élevée mais qui peuvent également vivre dans un milieu moins acide, neutre ou basique).
Le qualificatif acidiphile (avec un « i ») s'applique à un constituant cellulaire qui a une affinité pour les colorants acides[réf. nécessaire].
Le qualificatif acidicline s'applique à une espèce ayant une légère préférence pour les sols acides.
Quelques eucaryotes unicellulaires peuvent vivre à des pH inférieur à 1, c'est le cas de certains champignons comme Acontium cylatium, Cephalosporium sp. et Trichosporon cerebriae. L'algue rouge Cyanidium caldarium vit à un pH inférieur à 1.
Des espèces d'Archaea sont les acidophiles les plus extrêmes. Les Sulfolobus ont un pH optimal proche de 2. Des espèces des genres Thermoplasma ou Picrophilus survivent dans des eaux dont le pH est proche de zéro. Picrophilus oshimae et Picrophilus torridus ont été isolés dans une solfatare caractérisée par un pH extrêmement acide. Le pH environnemental optimal de ces bactéries est de 0,7. Ferroplasma acidarmanus peut croître à un pH zéro. Des cyanobactéries, dites « algues bleues », peuvent coloniser des milieux hyperacides (pH de 0) comme les lacs acides des volcans. La plupart des micro-organismes acidophiles vivent dans des environnements contenant du soufre ou ses composés comme des environnements géothermiques, des sources chaudes contenant du soufre. On en trouve aussi dans le vinaigre, le jus de citron ou les fluides gastriques.
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