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Pour les articles homonymes, voir Ciliata.
Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Ciliata (Ciliophora, Ciliophores, Ciliés), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre leurs différents groupes (ou taxa), telles que les dernières analyses reconnues les proposent. Ce n'est qu'une possibilité, et les principaux débats qui subsistent au sein de la communauté scientifique sont brièvement présentés ci-dessous, avant la bibliographie.
Le cladogramme présenté ici ne possède qu'une valeur indicative. Il n'est pas forcément consensuel, et on peut toujours se référer à la bibliographie au bas de l'article.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré. Tout nœud de l'arbre portant plus de deux branches montre une indétermination de la phylogénie interne du groupe considéré.
Les habitudes typographiques des botanistes et des zoologistes sont différentes. Ici, par commodité de lecture, et certains groupes actuels relevant des deux domaines traditionnels, les noms de taxons supérieurs au genre sont tous écrits en caractères droits, les noms de genres ou d'espèces en italiques.
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien ; (Edi) : Édiacarien. Pour plus de précision si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
▲ └─o Ciliophora ou Ciliata ├─o Postciliodesmatophora │ ├─o Karyorelictea │ └─o Heterotrichea └─o Intramacronucleata ├─o Spirotrichea │ ├─o Hypotrichia │ ├─o Stichotrichia │ ├─o Oligotrichia │ └─o Choreotrichia ├─o Litostomatea │ ├─o Trichostomatia │ └─o Haptoria ├─o Phyllopharyngea │ ├─o Phyllopharyngia │ ├─o Rhynchodia │ ├─o Chonotrichia │ └─o Suctoria ├─o Nassophorea ├─o Colpodea ├─o Prostomatea ├─o Plagiopylida └─o Oligohymenophorea ├─o Apostomatia ├─o Peritrichia ├─o Astomatida └─o Scuticociliatida
Arbre développé
▲ └─o Ciliophora ou Ciliata ├─o Exocolpodidae ├─o Postciliodesmatophora │ ├─o Karyorelictea │ │ ├─o Protostomatida │ │ │ ├─o Kentrophoridae │ │ │ └─o Trachelocercidae │ │ ├─o Protoheterotrichida ou Geleiidae │ │ └─o Loxodida │ │ ├─o Loxodidae │ │ └─o Cryptopharyngidae │ └─o Heterotrichea │ ├─o Licnophorida │ └─o Heterotrichida │ ├─o Folliculinidae │ ├─o Peritromidae │ ├─o Stentoridae │ ├─o Blepharismidae │ ├─o Spirostomidae │ ├─o Condylostomatidae │ └─o Climacostomidae └─o Intramacronucleata ├─o Spirotrichea │ ├─? Armophorida │ │ ├─o Metopidae │ │ └─o Caenomorphidae │ ├─? Phacodiniida │ ├─? Odontostomatida │ │ ├─o Mylestomatidae │ │ ├─o Discomorphellidae │ │ └─o Epalxellidae │ ├─? Clevelandellida │ │ ├─o Clevelandellidae │ │ ├─o Nyctotheridae │ │ ├─o Sicuophoridae │ │ └─o Neonyctotheridae │ ├─o Protocruziidia │ ├─o Hypotrichia │ │ ├─o Kiitrichida │ │ │ ├─? Transitellidae │ │ │ └─o Kiitrichidae │ │ └─o Euplotida │ │ ├─o Discocephalina │ │ │ ├─o Erionellidae │ │ │ └─o Discocephalidae │ │ └─o Euplotina │ │ ├─o Uronychiidae │ │ ├─o Aspidiscidae │ │ ├─o Certesiidae │ │ ├─o Gastrocirrhidae │ │ └─o Euplotidae │ ├─o Stichotrichia │ │ ├─o Plagiotomida │ │ ├─o Urostylida │ │ │ ├─o Urostylidae │ │ │ ├─o Pseudourostylidae │ │ │ └─o Pseudokeronopsidae │ │ ├─o Sporadotrichida │ │ │ ├─o Trachelostylidae │ │ │ └─o Oxytrichidae │ │ └─o Stichotrichida │ │ ├─o Spirofilidae │ │ ├─o Psilotrichidae │ │ ├─o Keronidae │ │ ├─o Epiclintidae │ │ ├─o Amphisiellidae │ │ └─o Kahliellidae │ ├─o Oligotrichia │ │ ├─o Halteriida │ │ └─o Strombidiida │ └─o Choreotrichia │ ├─o Choreotrichida │ │ ├─o Strobilidiidae │ │ ├─o Strombidinopsidae │ │ ├─o Leegaardiellidae │ │ └─o Lohmanniellidae │ └─o Tintinnida │ ├─o Dictyocystidae │ ├─o Tintinnidiidae │ ├─o Codonellidae │ ├─o Codonellopsidae │ ├─o Nolaclusiliidae │ ├─o Metacylididae │ ├─o Ascampbelliellidae │ ├─o Epiplocylididae │ ├─o Rhabdonellidae │ ├─o Ptychocylidae │ ├─o Petalotrichidae │ ├─o Cyttarocylididae │ ├─o Xystonellidae │ ├─o Undellidae │ └─o Tintinnidae ├─o Litostomatea │ ├─o Trichostomatia │ │ ├─o Coelosomidae │ │ ├─o Trichospiridae │ │ ├─? Macropodiniidae │ │ ├─o Vestibuliferida │ │ │ ├─o Paraisotrichidae │ │ │ ├─o Amylovoracidae │ │ │ ├─o Isotrichidae │ │ │ ├─o Balantidiidae │ │ │ └─o Pycnotrichidae │ │ └─o Entodiniomorphida │ │ ├─o Buetschliidae ou Archistomatina │ │ ├─o Blepharocorythidae │ │ └─o Entodiniomorphina │ │ ├─o Ophryoscolecidae │ │ ├─o Cycloposthiidae │ │ ├─o Spirodiniidae │ │ └─o Troglodytellidae │ └─o Haptoria │ ├─o Cyclotrichida ou Mesodiniidae │ ├─o Pleurostomatida │ │ ├─o Amphileptidae │ │ └─o Litonotidae │ └─o Haptorida │ ├─o Pseudoholophryidae │ ├─o Didiniidae │ ├─o Pseudotrachelocercidae │ ├─o Actinobolinidae │ ├─o Tracheliidae │ ├─o Helicoprorodontidae │ ├─o Pleuroplitidae │ ├─o Lacrymariidae │ ├─o Homalozoonidae │ ├─o Enchelyidae │ ├─o Acropisthiidae │ ├─o Fuscheriidae │ ├─o Spathidiidae │ ├─o Enchelyodontidae │ └─o Trachelophyllidae ├─o Phyllopharyngea │ ├─o Phyllopharyngia │ │ ├─o Dysteriida │ │ │ ├─o Kyaroikeidae │ │ │ ├─o Plesiotrichopidae │ │ │ ├─o Hartmannulidae │ │ │ └─o Dysteriidae │ │ └─o Chlamydodontida │ │ ├─o Kryoprorodontidae │ │ ├─o Chitonellidae │ │ ├─o Gastronautidae │ │ ├─o Chlamydodontidae │ │ ├─o Chilodonellidae │ │ └─o Lynchellidae │ ├─o Rhynchodia │ │ ├─o Hypocomatida ou Hypocomidae │ │ └─o Rhynchodida │ │ ├─o Sphenophryidae │ │ └─o Ancistrocomidae │ ├─o Chonotrichia │ │ ├─o Cryptogemmida │ │ │ ├─o Actinichonidae │ │ │ ├─o Isochonopsidae │ │ │ ├─o Isochonidae │ │ │ ├─o Inversochonidae │ │ │ ├─o Stylochonidae │ │ │ └─o Echinichonidae │ │ └─o Exogemmida │ │ ├─o Phyllochonidae │ │ ├─o Chilodochonidae │ │ ├─o Spirochonidae │ │ ├─o Filichonidae │ │ ├─o Heliochonidae │ │ └─o Lobochonidae │ └─o Suctoria │ ├─o Evaginogenida │ │ ├─o Cyathodiniidae │ │ ├─o Dendrocometidae │ │ └─o Discophryidae │ ├─o Endogenida │ │ ├─o Dendrosomatidae │ │ ├─o Trichophryidae │ │ ├─o Enchelyomorphidae │ │ ├─o Endosphaeridae │ │ ├─o Acinetidae │ │ └─o Tokophryidae │ └─o Exogenida │ ├─o Phalacrocleptidae │ ├─o Stylostomatidae │ ├─o Rhabdophryidae │ ├─o Ophryodendridae │ ├─o Spelaeophryidae │ ├─o Ephelotidae │ ├─o Parapodophryidae │ ├─o Podophryidae │ ├─o Tachyblastonidae │ ├─o Metacinetidae │ ├─o Thecacinetidae │ ├─o Paracinetidae │ ├─o Urnulidae │ └─o Corynophryidae ├─o Nassophorea │ ├─o Colpodidiidae │ ├─o Microthoracida │ │ ├─o Discotrichidae │ │ ├─o Microthoracidae │ │ └─o Pseudomicrothoracidae │ ├─o Nassulida │ │ ├─o Nassulidae │ │ ├─o Furgasoniidae │ │ └─o Paranassulidae │ └─o Synhymeniida │ ├─o Nassulopsidae │ ├─o Synhymeniidae │ ├─o Orthodonellidae │ └─o Scaphidiodontidae ├─o Colpodea │ ├─? Pseudochlamydonellidae │ ├─? Tectohymenidae │ ├─o Bryophryida │ ├─o Cyrtolophosidida │ │ ├─o Cyrtolophosididae │ │ ├─o Sagittariidae (Ciliata) │ │ ├─o Woodruffiidae │ │ └─o Platyophryidae │ ├─o Bursariomorphida │ │ ├─o Bursariidae │ │ └─o Bursaridiidae │ ├─o Sorogenida │ ├─o Bryometopida │ │ ├─o Jaroschiidae │ │ ├─o Trihymenidae │ │ ├─o Bryometopidae │ │ └─o Kreyellidae │ └─o Colpodida │ ├─o Grossglockneriidae │ ├─o Marynidae │ ├─o Colpodidae │ ├─o Hausmanniellidae │ └─o Bardeliellidae ├─o Prostomatea │ ├─o Prostomatida │ │ ├─o Apsiktratidae │ │ └─o Metacystidae │ └─o Prorodontida │ ├─o Plagiocampidae │ ├─o Malacophryidae │ ├─o Balanionidae │ ├─o Urotrichidae │ ├─o Placidae │ ├─o Colepidae │ ├─o Lagynidae │ ├─o Prorodontidae │ └─o Holophryidae ├─o Plagiopylida │ ├─o Trimyemidae │ ├─o Sonderiidae │ └─o Plagiopylidae └─o Oligohymenophorea ├─o Peniculida │ ├─o Parameciina │ │ ├─o Urocentridae │ │ ├─o Neobursaridiidae │ │ └─o Parameciidae │ └─o Frontoniina │ ├─o Lembadionidae │ ├─o Maritujidae │ ├─o Stokesiidae │ ├─o Clathrostomatidae │ └─o Frontoniidae ├─o Hymenostomatida │ ├─o Ophryoglenina │ │ ├─o Ichthyophthiriidae │ │ └─o Ophryoglenidae │ └─o Tetrahymenina │ ├─o Curimostomatidae │ ├─o Spirozonidae │ ├─o Tetrahymenidae │ ├─o Turaniellidae │ └─o Glaucomidae ├─o Apostomatia │ ├─o Pilisuctorida ou Conidophryidae │ ├─o Astomatophorida ou Opalinopsidae │ └─o Apostomatida │ ├─o Colliniidae │ ├─o Foettingeriidae │ └─o Cyrtocaryidae ├─o Peritrichia │ ├─o Mobilida │ │ ├─o Trichodinidae │ │ ├─o Urceolariidae │ │ ├─o Leiotrochidae │ │ ├─o Polycyclidae │ │ └─o Trichodinopsidae │ └─o Sessilida │ ├─o Termitophryidae │ ├─o Astylozoidae │ ├─o Opisthonectidae │ ├─o Ophrydiidae │ ├─o Vaginicolidae │ ├─o Ellobiophryidae │ ├─o Lagenophryidae │ ├─o Usconophryidae │ ├─o Rovinjellidae │ ├─o Vorticellidae │ ├─o Zoothamniidae │ ├─o Operculariidae │ ├─o Scyphidiidae │ └─o Epistylididae ├─o Astomatida │ ├─o Archiastomatidae │ ├─o Anoplophryidae │ ├─o Haptophryidae │ ├─o Clausilocolidae │ ├─o Maupasellidae │ ├─o Intoshellinidae │ ├─o Contophryidae │ ├─o Radiophryidae │ └─o Hoplitophryidae └─o Scuticociliatida ├─o Thigmotrichida │ ├─o Ancistridae │ ├─o Hemispeiridae │ ├─o Hysterocinetidae │ └─o Paraptychostomidae ├─o Pleuronematida │ ├─o Calyptotrichidae │ ├─o Ctedoctematidae │ ├─o Histiobalantiidae │ ├─o Peniculistomatidae │ ├─o Pleuronematidae │ ├─o Dragescoidae │ ├─o Cyclidiidae │ ├─o Conchophthiridae │ └─o Thigmocomidae └─o Philasterida ├─o Thigmophryidae ├─o Urozonidae ├─o Cinetochilidae ├─o Loxocephalidae ├─o Pseudocohnilembidae ├─o Uronematidae ├─o Entorhipidiidae ├─o Entodiscidae ├─o Cryptochilidae ├─o Cohnilembidae ├─o Philasteridae ├─o Thyrophylacidae ├─o Paralembidae ├─o Orchitophryidae └─o Parauronematidae
Isotricha intestinalis
Classification proposée par Adl et al. 2005
Ce comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Ciliophora ou Ciliata.
Classification proposée par Adl et al. 2005
▲ └─o Ciliophora ├─o Postciliodesmatophora │ ├─o Karyorelictea │ └─o Heterotrichea └─o Intramacronucleata ├─o Spirotrichea │ ├─o Protocruzia │ ├─o Phacodinium │ ├─o Licnophora │ ├─o Hypotrichia │ ├─o Oligotrichia │ ├─o Choreotrichia │ └─o Stichotrichia ├─o Armophorea │ ├─o Armophorida │ ├─o Clevelandellida │ └─o Odontostomatida ├─o Litostomatea │ ├─o Haptoria │ └─o Trichostomatia ├─o Phyllopharyngea │ ├─o Cyrtophoria │ ├─o Chonotrichia │ ├─o Rhynchodia │ └─o Suctoria ├─o Nassophorea ├─o Colpodea ├─o Prostomatea ├─o Plagiopylea └─o Oligohymenophorea ├─o Peniculia ├─o Scuticociliatia ├─o Hymenostomatia ├─o Apostomatia ├─o Peritrichia └─o Astomatia
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