Au col du Télégraphe le groupe des échappés compte 2 min 50 d'avance. Durant la montée des 17 km du col du Galibier, Óscar Pereiro est lâché et repris par le peloton. Peu après, le kazaque Vinokourov et le colombien Botero parviennent au sommet avec 2 min 40 secondes d'avance sur le groupe de poursuivants qui comprend Lance Armstrong et les principaux favoris. Les deux coureurs parviennent à consolider leur avance et à assurer la victoire d'étape à Alexandre Vinokourov qui l'emporte au sprint devant Santiago Botero. Le groupe Armstrong arrive avec un retard de 1 min 15.
L'ItalienDario Frigo de l'équipe cycliste Fassa Bortolo et sa femme ont été mis en examen et incarcérés à Courchevel avant le départ à la suite d'un contrôle de routine de la douane volante près de Chambéry qui a permis de découvrir des produits dopants dont de l'EPO dans le coffre de la voiture de son épouse. Dario était récidiviste du fait car il s'était déjà fait prendre avec des produits dopants en 2001 lors du Tour d'Italie.