Mekrijärven tutkimusasema on aiempi Itä-Suomen yliopiston erillislaitos Ilomantsissa, Mekrijärven kylässä Mekrijärven rannalla. Aseman vuonna 1924 valmistuneessa päärakennuksessa on aiemmin toiminut myös Mekrijärven koulu. Joensuun yliopisto osti kiinteistön Ilomantsin kunnalta vuonna 1973 ja perusti sinne tutkimusaseman. Yliopisto päätti sulkea tutkimusaseman alkukesällä 2015 tekemällään päätöksellä ja luopua Mekrijärven tutkimusaseman toiminnoista 2016 loppuun mennessä.