Ellilä kävi kansakoulun jälkeen Itä-Hämeen kansanopiston ja perusti sitten kotikyläänsä nuorisoseuran ja useita opintokerhoja. Mentyään naimisiin hän muutti vuonna 1920 Heinolaan, missä hän työskenteli toimitusharjoittelijana Heinolan Sanomat- ja Heinolainen-lehdissä (1926-1927). Vuonna 1926 Ellilä siirtyi Porvooseen, missä hän toimi aina vuoteen 1957 saakka WSOY:n palveluksessa kustannusvirkailijana. WSOY:n palveluksessa hän oli Nuoren Voiman Liiton toiminnanjohtaja 1926-1937 ja uudelleen 1941-1944. Kansan Kuvalehden päätoimittaja 1927-1934 ja Uudenmaan Sanomien va. päätoimittaja 1941-1943.[1] Ellilä oli kiinnostunut nuorisoseura- ja kansanvalistustoiminnasta ja hän aloitti kirjallisuuden keräämisen jo nuoruusvuosinaan.
Ellilä sai SKR:n tunnustuspalkinnon 1949 ja kirjastoneuvoksen arvonimen 1953.
Ellilän kokoelmassa oli suomalaisten kirjailijoiden teosten ensipainoksia 1900-luvun alusta aina 1960- ja 1970-luvuille saakka. Ellilä lahjoitti 1960-luvulla 20000 teosta Helsingin yliopiston kirjastolle ja 7000 teosta Harvardin yliopiston kirjastolle. Vuonna 1977 hän lahjoitti vielä 3200 teosta Lahden kaupunginkirjastolle.
Suomen nuorisoseuraliike: lyhyt yleiskatsaus. 1928
Nuorisoseurakirjallisuus. Omakustanne, Helsinki 1931
Suomenkielinen kansanopistokirjallisuus. Omakustanne, Helsinki 1931
Werner Söderström osakeyhtiön ja Kustannusosakeyhtiö Kirjan näytelmät: selostava luettelo, toimittanut E. J. Ellilä. WSOY 1932
Rope Kojonen kirjoittajana. Lahti 1933
Yrjö Hirvoinen, "Heinolan runoilija" Omakustanne, Helsinki 1933
Luettelo Aleksis Kiven teoksista eri painoksineen sekä niiden käännöksistä ja mukailuista. 1934
Nuorisoseurojen käsikirjastot. Etelä-Hämeen nuorisoseurojen liitto, Lahti 1934
Aleksis Kiven teosten ja Kiveä koskevan kirjallisuuden luettelo. NVL:n kirjanystävien harrastuspiiri, Porvoo 1935
Suomen kansanopisto ja sen työntekijät 1. 1. 1935, toimittaneet E. J. Ellilä ym. WSOY 1935
Sanainen arkku: mietelmiä kirjoista ja lukemisesta. Gummerus 1936
Vieraana Hitlerin maassa: "pöytäkirja" Saksan matkalta. Porvoo 1936
Adam Honkanen, Hartolan seurakunnasta. Hartolan seurakunta 1938
Maila Talvion tähänastiset kirjalliset julkaisut. NVL:n kirjanystävien harrastuspiiri, Porvoo 1938
Elävä kirjain: yhdeksän lukua kirjoitustaidon ja kirjapainotaidon kehityshistoriasta. WSOY 1947
Kirja on kohtaloni. Gummerus 1948
Oma kirjastoni: suomalaisia yksityiskirjastoja omistajiensa kuvaamina. WSOY 1949
Tämä on minun exlibrikseni: uusia suomalaisia kirjanomistajanmerkkejä, toimittanut E. J. Ellilä. Gummerus 1949
Kirjallisia salanimiä ja nimimerkkejä. 1952, 2. täydennetty painos SKS 1966
Kirjojen taika. Porvoo: WSOY, 1952.
Werner Söderström osakeyhtiön juhlaluettelo 1878-1953 / Jubilee catalogue of Werner Söderström oy. 1878-1953, toimittanut E. J. Ellilä avustajinaan Leena Karro ym, historiikin kirjoittanut Yrjö A. Jäntti. WSOY 1953
Lukijan persoonallinen suhde kirjaan. Omakustanne, Porvoo 1956
Tehty seisoo ja sanottu pysyy: hokuja, sutkauksia ja sananparsia Sysmän pitäjästä, kerännyt E. J. Ellilä. Omakustanne, Porvoo 1957
Kirjan vuosisata: suomenkielisen kirjan vaiheilta kansallisen heräämisen vuosisadalla: muistiinpanoja. Uusimaa, Povoo 1959
Werner Söderström osakeyhtiön juhlaluettelo, osa 2: Kustannustuotanto 1953-1958, luettelot toimittanut E. Ellilä. WSOY 1959
Erik Johan Blom, Sysmän kappalainen. 1960
Piekkolan lähde sekä muita itähämäläisiä kotiseutuaiheita: 16 kuvaa. Heinola 1961
"En huoli sinun viinastas": väkijuomien käyttö ja raittius Aleksis Kiven kuvaamana. Suomen raittiusjärjestöjen liitto, Helsinki 1962
Mikä on kirja. Omakustanne, Porvoo 1962
E. J. Ellilän kirjaston luettelo, osa 1 A-L. Helsingin yliopiston kirjasto 1964
Itähämäläisiä kirjailijoita: Erik Johan Blomista Kaarina Helakisaan. Heinola 1966
E. J. Ellilän kirjaston luettelo, osa 1 M-Ö, käsikirjoitukset. Helsingin yliopiston kirjasto 1967
Kirjallisen tuotantoni luettelo 1905-1968, Helsingin yliopiston kirjaston monistesarja 2. 1969