Pyhäjoki voi tarkoittaa muiden muassa seuraavia:
- Pyhäjoki, kunta Pohjois-Pohjanmaalla
- Pyhäjoki, joki Pohjois-Pohjanmaalla
- Pyhäjoki, kylä Säkylässä Satakunnassa
- Pyhäjoki, joki Säkylässä Satakunnassa
- Pyhäjoki, kylä ja historiallinen kartano Salossa Varsinais-Suomessa