حسین خامنهای در خامنه به دنیا آمد و در حوزهٔ علمیهٔ نجف، در زمرهٔ فقها و مدرسان آن حوزه و از علمای طرفدار جنبش مشروطه ایران بود. پدر علی خامنهای، سید
سیّد علی حسینی خامنه (زادهٔ ۲۹ فروردین ۱۳۱۸)، معروف به سیّد علی خامنهای، سیاستمدار و دوّمین رهبر جمهوری اسلامی ایران است که از سال ۱۳۶۸ در این مقام میباشد
معرفت،میرزا جعفر نقوی خامنه ای٫ موسی احمدی٫دکتر علی اکبر عرشی خامنه٫پرفسور فریدون بابایی خامنه٫صادق خان خامنه٫ صمد صمدیانپور، سید علی خامنهای رهبر دوم
هادی خامنهای؛ برادر کوچکتر بدری خامنهای؛ خواهر سید مجتبی خامنهای (زاده ۱۳۴۸)؛ پسر دوم همچنین اشخاص زیر: جعفرخامنهای؛ شاعر این صفحهٔ ابهامزدایی مقالههای