From Wikipedia, the free encyclopedia
کلاستال (به انگلیسی: Clustal) یکی از برنامههای رایانهای معروف برای هم تراز کردن چندگانه توالیها است. آخرین نسخهٔ این برنامه، ویرایش ۲٫۱ آن میباشد. دو گونهٔ مختلف از این برنامه موجود است:
نویسنده(های) اصلی | تی. گیبسون، جی. تامپسون، دی. هیگینز |
---|---|
سیستمعامل | ویندوز مک اواس گنو/لینوکس یونیکس |
مجوز | رایگان برای استفادهٔ آکادمیک |
وبگاه |
این برنامه از وبگاه کلاستال یا سرور اف.تی.پی انستیتو بیوانفورماتیک اروپا قابل دسترسی است.
این برنامه قالبهای گوناگونی را به عنوان ورودی میپذیرد؛ برخی از آنها عبارتاند از: NBRF/PIR, FASTA, EMBL/Swissprot, Clustal, GCC/MSF, GCG9 RSF و GDE.
خروجی این برنامه میتواند در قالب یکی یا چند تا از قالبهای Clustal, NBRF/PIR, GCG/MSF, PHYLIP, GDE یا NEXUS باشد.
در الگوریتم کلاستال برای هم تراز کردن چند توالی با هم سه گام اصلی وجود دارد:
با انتخاب گزینهٔ "Do Complete Alignment" همهٔ این مراحل بهطور خودکار انجام میشوند. گزینههای دیگر شامل "Do Alignment from guide tree" و "Produce guide tree only" میباشد.
کاربران میتوانند هم تراز کردن توالیها را با تنظیمات پیش فرض انجام دهند؛ هرچند معمولاً با تغییر دادن تنظیمات با پارامترهای خاص خود نتیجهٔ بهتری بدست میآید. این پارامترها، جریمهٔ گشایش فاصله و جریمهٔ گسترش فاصله میباشند.
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.