شاخه‌ای از باکتری From Wikipedia, the free encyclopedia
اسیدوباکتریوتا (Acidobacteriota) شاخه‌ای از باکتری‌های گرم-منفی هستند. اعضای آن از نظر فیزیولوژیکی متنوع و در همه‌جا به‌ویژه خاک حضور دارند.[4][5][6]
| اسیدوباکتریوتا | |
|---|---|
 | |
| Acidobacterium cf. capsulatum | |
رده‌بندی علمی  | |
| Missing taxonomy template (fix): | Acidobacteriota |
| سرده نماد | |
| اسیدوباکتریوم Kishimoto et al. 1991 | |
| Classes[1] | |
| |
| مترادف | |
| |
اعضای این شاخهٔ زیستی از نظر فیزیولوژیکی متنوع هستند و می‌توانند در محیط‌های مختلفی از جمله خاک، چوب در حال تجزیه،[7] چشمه‌های آب‌گرم، اقیانوس‌ها، غارها و خاک‌های آلوده به فلز یافت شوند.[8] اعضای این شاخه به‌ویژه در زیستگاه‌های خاکی فراوان هستند که تا ۵۲ درصد از کل جمعیت باکتریایی را تشکیل می‌دهند.[9] دیده شده‌است که عوامل محیطی مانند پی‌اچ و مواد مغذی، پویایی اسیدوباکتری‌ها را هدایت می‌کنند.[10][11][12] بسیاری از گونه‌های اسیدوباکتریوتا از جمله نخستین عضو توصیف‌شده از این شاخه، Acidobacterium capsulatum، اسیددوست هستند.[13]
گونه‌های قابل توجه دیگر اسیدوباکتریوتا عبارت‌اند از Holophaga foetida ,[14] Geothrix fermentans ,[15] Acanthopleuribacter pedis[16] و Bryobacter aggregatus.[17] از آن‌جایی که آن‌ها اخیراً کشف شده‌اند و بیشتر آن‌ها کشت نشده‌اند، اکولوژی و متابولیسم این باکتری‌ها به‌خوبی درک نشده‌است.[5] با این‌حال، این باکتری‌ها ممکن است نقش مهمی در اکوسیستم‌ها داشته باشند، زیرا آن‌ها به‌طور ویژه در خاک فراوان هستند.[18] اعضای گروه‌های نام‌گذاری‌نشدهٔ ۱، ۴ و ۶ به‌ویژه در خاک‌ها فراوان هستند.[19]
اسیدوباکترهای زیرمجموعهٔ طبقه‌بندی‌نشدهٔ شماره ۲ علاوه بر خاک که زیستگاه طبیعی آن‌هاست به‌عنوان آلایندهٔ معرف‌های کیت‌های استخراج دی‌ان‌ای شناسایی شده‌است.[20]
اعضای زیربخش ۱ در شرایط پی‌اچ پایین غالب هستند.[21] به‌علاوه، اسیدوباکتری‌های حاصل از زه‌کشی معادن اسیدی در مقایسه با اسیدوباکترهای خاک،[22] به‌طور بالقوه به‌دلیل سازگاری سلولی و پایداری آنزیم‌ها، با شرایط پی‌اچ اسیدی (پی‌اچ ۲–۳) سازگارتر هستند.[10]
محتوای سیتوزین-گوانین ژنوم‌های اسیدوباکتری‌ها در زیرشاخه‌های آن‌ها مشابه است. (بالای ۶۰ درصد برای گروه ۵ و تقریباً ۱۰ درصد کمتر، برای گروه ۳)[5]
اکثر اسیدوباکتریوتاها هوازی محسوب می‌شوند. برخی از آن‌ها در زیربخش ۸ و ۲۳[15][23] بی‌هوازی در نظر گرفته می‌شوند. مشخص شده‌است که برخی از سویه‌های اسیدوباکتر که از خاک منشأ می‌گیرند، پتانسیل ژنومی برای تنفس اکسیژن در غلظت‌های اتمسفر و زیر اتمسفر را دارند.[24]
این باکتری‌ها به‌دلیل فراوانی زیاد در محیط‌های کم کربن آلی، باکتری الیگوتروف در نظر گرفته شده‌اند.[10] با این‌حال، تنوع در این شاخه نشان می‌دهد که آن‌ها ممکن است استراتژی اکولوژیکی یکسانی نداشته باشند.[10]
برخی از اعضای زیربخش ۱ می‌توانند از دی-گلوکز، دی-زایلوز و لاکتوز به‌عنوان منبع کربن استفاده کنند،[10] اما قادر به استفاده از فوکوز یا سوربوز نیستند.[25] اعضای زیربخش ۱ همچنین حاوی آنزیم‌هایی مانند گالاکتوزیدازها هستند که در تجزیهٔ قندها استفاده می‌شوند.[10] مشخص شده‌است که اعضای زیربخش ۴ از کیتین به‌عنوان منبع کربن استفاده می‌کنند.[24][26][27]
هیچ شواهد روشنی مبنی بر این‌که اسیدوباکترها در فرایندهای چرخهٔ نیتروژن مانند نیتریفیکاسیون، نیتروژن‌زدایی یا تثبیت نیتروژن دخیل باشند، وجود ندارد.[10] با این‌حال نشان داده شد که Geothrix fermantans قادر به کاهش نیترات بوده و حاوی ژن norB است.[10] ژن NorB در Koribacter verstailis و Solibacter usitatus نیز شناسایی شد.[10][28] علاوه بر این، وجود ژن nirA در اعضای زیربخش ۱ مشاهده شده‌است.[10] علاوه بر این، تا به امروز، تمام ژنوم‌ها برای جذب مستقیم آمونیوم از طریق ژن‌های خانوادهٔ ناقل کانال آمونیوم توصیف شده‌اند.[10][24] اسیدوباکتریوتا می‌تواند از نیتروژن معدنی و آلی به‌عنوان منابع نیتروژن خود استفاده کند.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.
