APG III (akronüüm ingliskeelsest fraasist Angiosperm Phylogeny Group III system) on kolmas, peamiselt molekulaar-fülogeneetilisel uuringutel põhinev taimede klassifitseerimissüsteem, mis avalikustati 2009. aastal. Selle järglaseks on 2016. aastal välja antud APG IV süsteem.
Taimede süstematiseerimine liigist ja perekonnast kõrgematesse taksonitesse enne detailsete geneetiliste tõendite kasutusele võtmist, põhines taimede morfoloogial ja biokeemial. Erinevate botaanikute juhtimisel koostati mitmeid süsteeme, millest üks tuntuim, 1968. aastal Arthur Cronquisti loodud ja 1981. aastal avaldatud Cronquisti süsteem, on siiani mitmetes riikides kasutatav. Fülogeneetiliste uuringute valguses ei peeta Cronquisti süsteemi enam taimede fülogeneesi õigesti kajastavaks ning rahvusvahelise süstemaatikute-botaanikute rühma Angiosperm Phylogeny Group (APG), kelle eesmärgiks on luua konsensuslik õistaimede taksonoomia, koostöö tulemusena on avaldatud neli pidevalt täienevat versiooni katteseemnetaimede fülogeneetilisest klassifitseerimissüsteemist: APG I (1998), APG II (2003), APG III (2009) ning APG IV (2016)[1].
APG III tunnistas kõiki 45 eelmistes süsteemides kasutusel olnud seltsi ning lisas 14 uut. Selts Ceratophyllales märgiti ekslikult uueks seltsiks, kuigi see oli olemas olnud juba kahes eelmises APG süsteemis. Uued seltsid on: Amborellales, Nymphaeales, Chloranthales, Petrosaviales, Trochodendrales, Buxales, Vitales, Zygophyllales, Picramniales, Huerteales, Berberidopsidales, Escalloniales, Bruniales ja Paracryphiales.
Uues süsteemis loobuti 2003. aasta versioonis kasutusele võetud nn "sulgudes" sugukondadest. APG III süsteem tunnistab 415 sugukonda. Seda on 42 võrra vähem kui eelmises süsteemis. 55 sulgudes sugukonnast loobuti 44, loobuti veel ka 18 eelmistes süsteemides kasutusel olnud sugukonnast.
Tühistatud "sulgudes" sugukonnad: Illiciaceae, Alliaceae, Agapanthaceae, Agavaceae, Aphyllanthaceae, Hesperocallidaceae, Hyacinthaceae, Laxmanniaceae, Ruscaceae, Themidaceae, Asphodelaceae, Hemerocallidaceae, Kingdoniaceae, Fumariaceae, Pteridophyllaceae, Didymelaceae, Tetracentraceae, Pterostemonaceae, Hypseocharitaceae, Francoaceae, Memecylaceae, Lepuropetalaceae, Rhoipteleaceae, Medusagynaceae, Quiinaceae, Malesherbiaceae, Turneraceae, Bretschneideraceae, Diegodendraceae, Cochlospermaceae, Peganaceae, Tetradiclidaceae, Nyssaceae, Ternstroemiaceae, Pellicieraceae, Aucubaceae, Donatiaceae, Lobeliaceae, Desfontainiaceae, Diervillaceae, Dipsacaceae, Linnaeaceae, Morinaceae ja Valerianaceae.
Tühistati sugukonnad: Limnocharitaceae, Luzuriagaceae, Sparganiaceae, Ledocarpaceae, Heteropyxidaceae, Psiloxylaceae, Oliniaceae, Rhynchocalycaceae, Parnassiaceae, Maesaceae, Myrsinaceae, Theophrastaceae, Eremosynaceae, Polyosmaceae, Tribelaceae, Aralidiaceae, Mackinlayaceae ja Melanophyllaceae.
Kasutusele võeti 20 uut sugukonda ning mõned sugukonnad liigitati ümber. Uued sugukonnad on: Petermanniaceae, Schoepfiaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae, Talinaceae, Anacampserotaceae, Centroplacaceae, Calophyllaceae, Guamatelaceae, Gerrardinaceae, Dipentodontaceae, Capparidaceae, Cleomaceae, Cytinaceae, Mitrastemonaceae, Metteniusaceae, Linderniaceae, Thomandersiaceae ja Quintiniaceae.
Seltsidesse mitte liigitatud sugukondade arv vähenes kolmekümne üheksalt kümneni. Apodanthaceae ja Cynomoriaceae paigutati katteseemnetaimede hulka incertae sedis. Veel kaheksa sugukonda paigutati incertae sedis erinevatesse katteseemnetaimede alamtaksonitesse.
Nendeks sugukondadeks on: Apodanthaceae, Cynomoriaceae, Dasypogonaceae, Sabiaceae, Dilleniaceae, Icacinaceae, Metteniusaceae, Oncothecaceae, Vahliaceae ja Boraginaceae.
Lahtiseks jäi sugukonna Icacinaceae taksonoomia. Apodytes, Emmotum, Cassinopsis ja veel mõned perekonnad loetakse sugukonda kuuluvaks seni, kuni uurimused seda kas kinnitavad või ümber lükkavad.
Kolm perekonda (Gumillea, Nicobariodendron ja Petenaea) paigutati katteseemnetaimede hulka incertae sedis. APG II süsteemis oli Gumillea taksonoomia määratlemata. Nicobariodendron ja Petenaea lisati alles nüüd. Viimane liigitati eraldi sugukonda Petenaeaceae seltsis Huerteales[2][3]
Allpool on ära toodud klassifikatsiooni kaks versiooni. Lühem versioon näitab sugukond-selts taset ning sugukondi, mis ei kuulu ühtegi seltsi. Samal tasemel asuvad sugukonnad on tähestikulises järjekorras. Tasuks tähele panna, et seltsi ei pruugi enam kuuluda samad sugukonnad, mis varasemates APG süsteemides.
Detailsema ülevaate taksonoomiast annab fülogeneetiline puu.
Legend:
* = sugukonna paigutus on muutunud;
† = uus selts APG süsteemis;
§ = sugukonna piirid kirjeldatud tekstis ;
$ = sugukonnad laiemas mõistes kui APG II süsteemis ;
$$ = sugukonnad, mis olid APG II süsteemis "sulgudes", siin eelistatud kitsamas mõistes
- †Amborellales Melikyan, A.V.Bobrov & Zaytzeva
- †Nymphaeales Salisb. ex Bercht. & J.Presl
- $$Cabombaceae Rich. ex A.Rich.
- *Hydatellaceae U.Hamann
- $$Nymphaeaceae Salisb.
- Austrobaileyales Takht. ex Reveal
- Austrobaileyaceae Croizat
- $Schisandraceae Blume (kaasa arvatud Illiciaceae A.C.Sm.)
- Trimeniaceae L.S.Gibbs
- †Chloranthales R.Br.
- Chloranthaceae R.Br. ex Sims
Magnoliidae
- Canellales Cronquist
- Canellaceae Mart.
- Winteraceae R.Br. ex Lindl.
- Piperales Bercht. & J.Presl
- Laurales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- Atherospermataceae R.Br.
- Calycanthaceae Lindl.
- Gomortegaceae Reiche
- Hernandiaceae Blume
- Lauraceae Juss.
- Monimiaceae Juss.
- Siparunaceae Schodde
- Magnoliales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- Annonaceae Juss.
- Degeneriaceae I.W.Bailey & A.C.Sm.
- Eupomatiaceae Orb.
- Himantandraceae Diels
- Magnoliaceae Juss.
- Myristicaceae R.Br.
- Acorales Link
- Alismatales R.Br. ex Bercht. & J.Presl
- †Petrosaviales Takht.
- Dioscoreales R.Br.
- Burmanniaceae Blume
- Dioscoreaceae R.Br.
- Nartheciaceae Fr. ex Bjurzon
- Pandanales R.Br. ex Bercht. & J.Presl
- Cyclanthaceae Poit. ex A.Rich.
- Pandanaceae R.Br.
- Stemonaceae Caruel
- Triuridaceae Gardner
- Velloziaceae J.Agardh
- Liliales Perleb
- §Alstroemeriaceae Dumort. (kaasa arvatud Luzuriagaceae Lotsy)
- Campynemataceae Dumort.
- Colchicaceae DC.
- Corsiaceae Becc.
- Liliaceae Juss.
- Melanthiaceae Batsch ex Borkh.
- *Petermanniaceae Hutch.
- Philesiaceae Dumort.
- Ripogonaceae Conran & Clifford
- Smilacaceae Vent.
- Asparagales Link
Kommeliniidid
- Dasypogonaceae Dumort.
- Arecales Bromhead
- Commelinales Mirb. ex Bercht. & J.Presl
- Poales Small
- Anarthriaceae D.F.Cutler & Airy Shaw
- Bromeliaceae Juss.
- Centrolepidaceae Endl.
- Cyperaceae Juss.
- Ecdeiocoleaceae D.F.Cutler & Airy Shaw
- Eriocaulaceae Martinov
- Flagellariaceae Dumort.
- Joinvilleaceae Toml. & A.C.Sm.
- Juncaceae Juss.
- Mayacaceae Kunth
- Poaceae Barnhart
- Rapateaceae Dumort.
- Restionaceae R.Br.
- Thurniaceae Engl.
- §Typhaceae Juss. (kaasa arvatud Sparganiaceae Hanin)
- Xyridaceae C.Agardh
- Zingiberales Griseb.
- Ranunculales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- Berberidaceae Juss.
- $Circaeasteraceae Hutch. (kaasa arvatud Kingdoniaceae Airy Shaw)
- Eupteleaceae K.Wilh.
- Lardizabalaceae R.Br.
- Menispermaceae Juss.
- $Papaveraceae Juss. (kaasa arvatud Fumariaceae Marquis, Pteridophyllaceae Nakai ex Reveal & Hoogland)
- Ranunculaceae Juss.
- Sabiaceae Blume
- Proteales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- †Trochodendrales Takht. ex Cronquist
- $Trochodendraceae Eichler (kaasa arvatud Tetracentraceae A.C.Sm.)
- †Buxales Takht. ex Reveal
- $Buxaceae Dumort. (kaasa arvatud Didymelaceae Leandri)
- *Haptanthaceae C.Nelson
- Gunnerales Takht. ex Reveal
- $$Gunneraceae Meisn.
- $$Myrothamnaceae Nied.
- Dilleniaceae Salisb.
- Saxifragales Bercht. & J.Presl
- †Berberidopsidales Doweld
- Aextoxicaceae Engl. & Gilg
- Berberidopsidaceae Takht.
- Santalales R.Br. ex Bercht. & J.Presl
- *Balanophoraceae Rich.
- Loranthaceae Juss.
- Misodendraceae J.Agardh
- Santalaceae R.Br.
- Olacaceae R.Br.
- Opiliaceae Valeton
- *Schoepfiaceae Blume
- Caryophyllales Juss. ex Bercht. & J.Presl
Rosiidid
- †Vitales Juss. ex Bercht. & J.Presl
Pärisrosiidid I
- †Zygophyllales Link
- Celastrales Link
- $Celastraceae R.Br. (kaasa arvatud Lepuropetalaceae Nakai, Parnassiaceae Martinov, Pottingeriaceae Takht.)
- Lepidobotryaceae J.Léonard
- Oxalidales Bercht. & J.Presl
- Brunelliaceae Engl.
- Cephalotaceae Dumort.
- Connaraceae R.Br.
- Cunoniaceae R.Br.
- Elaeocarpaceae Juss. ex DC.
- *Huaceae A.Chev.
- Oxalidaceae R.Br.
- Malpighiales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- Achariaceae Harms
- Balanopaceae Benth. & Hook.f.
- Bonnetiaceae L.Beauvis. ex Nakai
- *Calophyllaceae J.Agardh
- Caryocaraceae Voigt
- *Centroplacaceae Doweld & Reveal
- $$Chrysobalanaceae R.Br.
- §Clusiaceae Lindl.
- Ctenolophonaceae Exell & Mendonça
- $$Dichapetalaceae Baill.
- Elatinaceae Dumort.
- $$§Erythroxylaceae Kunth (kaasa arvatud Aneulophus Benth.)
- Euphorbiaceae Juss.
- $$Euphroniaceae Marc.-Berti
- Goupiaceae Miers
- Humiriaceae A.Juss.
- Hypericaceae Juss.
- Irvingiaceae Exell & Mendonça
- Ixonanthaceae Planch. ex Miq.
- Lacistemataceae Mart.
- Linaceae DC. ex Perleb
- Lophopyxidaceae H.Pfeiff.
- Malpighiaceae Juss.
- $Ochnaceae DC. (kaasa arvatud Medusagynaceae Engl. & Gilg, Quiinaceae Choisy)
- Pandaceae Engl. & Gilg
- $Passifloraceae Juss. ex Roussel (kaasa arvatud Malesherbiaceae D.Don, Turneraceae Kunth ex DC.)
- Phyllanthaceae Martinov
- Picrodendraceae Small
- Podostemaceae Rich. ex Kunth
- Putranjivaceae Meisn.
- *Rafflesiaceae Dumort.
- $$Rhizophoraceae Pers.
- Salicaceae Mirb.
- $$Trigoniaceae A.Juss.
- Violaceae Batsch
- Cucurbitales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- Anisophylleaceae Ridl.
- Begoniaceae C.Agardh
- Coriariaceae DC.
- Corynocarpaceae Engl.
- Cucurbitaceae Juss.
- Datiscaceae Dumort.
- Tetramelaceae Airy Shaw
- Fabales Bromhead
- Fagales Engl.
- Rosales Bercht. & J.Presl
Pärisrosiidid II
- Geraniales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- $Geraniaceae Juss. (kaasa arvatud Hypseocharitaceae Wedd.)
- $Melianthaceae Horan. (kaasa arvatud Francoaceae A.Juss.)
- §Vivianiaceae Klotzsch (kaasa arvatud Ledocarpaceae Meyen)
- Myrtales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- Alzateaceae S.A.Graham
- Combretaceae R.Br.
- Crypteroniaceae A.DC.
- Lythraceae J.St.-Hil.
- $Melastomataceae Juss. (kaasa arvatud Memecylaceae DC.)
- §Myrtaceae Juss. (kaasa arvatud Heteropyxidaceae Engl. & Gilg, Psiloxylaceae Croizat)
- Onagraceae Juss.
- §Penaeaceae Sweet ex Guill. (kaasa arvatud Oliniaceae Arn., Rhynchocalycaceae L.A.S.Johnson & B.G.Briggs)
- Vochysiaceae A.St.-Hil.
- Crossosomatales Takht. ex Reveal
- *Aphloiaceae Takht.
- Crossosomataceae Engl.
- *Geissolomataceae A.DC.
- *Guamatelaceae S.Oh & D.Potter
- Stachyuraceae J.Agardh
- Staphyleaceae Martinov
- *§Strasburgeriaceae Soler. (kaasa arvatud Ixerbaceae Griseb. ex Doweld & Reveal)
- †Picramniales Doweld
- *Picramniaceae Fernando & Quinn
- †Huerteales Doweld
- *Dipentodontaceae Merr.
- *Gerrardinaceae Alford
- Tapisciaceae Takht.
- Brassicales Bromhead
- $Akaniaceae Stapf (kaasa arvatud Bretschneideraceae Engl. & Gilg)
- Bataceae Mart. ex Perleb
- §Brassicaceae Burnett
- *Capparaceae Juss.
- Caricaceae Dumort.
- *Cleomaceae Bercht. & J.Presl
- Emblingiaceae J.Agardh
- Gyrostemonaceae A.Juss.
- Koeberliniaceae Engl.
- Limnanthaceae R.Br.
- Moringaceae Martinov
- Pentadiplandraceae Hutch. & Dalziel
- Resedaceae Martinov
- Salvadoraceae Lindl.
- Setchellanthaceae Iltis
- Tovariaceae Pax
- Tropaeolaceae Juss. ex DC.
- Malvales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- $Bixaceae Kunth (kaasa arvatud Cochlospermaceae Planch., Diegodendraceae Capuron)
- Cistaceae Juss.
- *Cytinaceae A.Rich.
- Dipterocarpaceae Blume
- Malvaceae Juss.
- Muntingiaceae C.Bayer, M.W.Chase & M.F.Fay
- Neuradaceae Kostel.
- Sarcolaenaceae Caruel
- Sphaerosepalaceae Tiegh. ex Bullock
- Thymelaeaceae Juss.
- Sapindales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- Anacardiaceae R.Br.
- Biebersteiniaceae Schnizl.
- Burseraceae Kunth
- Kirkiaceae Takht.
- Meliaceae Juss.
- $Nitrariaceae Lindl. (kaasa arvatud Peganaceae Tiegh. ex Takht., Tetradiclidaceae Takht.)
- Rutaceae Juss.
- Sapindaceae Juss.
- Simaroubaceae DC.
Asteriidid
- Cornales Link.
- Cornaceae Bercht. & J.Presl (kaasa arvatud Nyssaceae Juss. ex Dumort.)
- Curtisiaceae Takht.
- Grubbiaceae Endl. ex Meisn.
- Hydrangeaceae Dumort.
- Hydrostachyaceae Engl.
- Loasaceae Juss.
- Ericales Bercht. & J.Presl
- Actinidiaceae Engl. & Gilg.
- Balsaminaceae A.Rich.
- Clethraceae Klotzsch
- Cyrillaceae Lindl.
- Diapensiaceae Lindl.
- Ebenaceae Gürke
- Ericaceae Juss.
- Fouquieriaceae DC.
- Lecythidaceae A.Rich.
- Marcgraviaceae Bercht. & J.Presl
- *Mitrastemonaceae Makino
- $Pentaphylacaceae Engl. (kaasa arvatud Ternstroemiaceae Mirb. ex DC.)
- Polemoniaceae Juss.
- §Primulaceae Batsch ex Borkh. (kaasa arvatud Maesaceae Anderb., B.Ståhl & Källersjö, Myrsinaceae R.Br., Theophrastaceae G.Don)
- Roridulaceae Martinov
- Sapotaceae Juss.
- Sarraceniaceae Dumort.
- $$Sladeniaceae Airy Shaw
- Styracaceae DC. & Spreng.
- Symplocaceae Desf.
- $Tetrameristaceae Hutch. (kaasa arvatud Pellicieraceae L.Beauvis.)
- Theaceae Mirb. ex Ker Gawl.
Pärisasteriidid I
- §*Boraginaceae Juss. (kaasa arvatud Hoplestigmataceae Gilg)
- Vahliaceae Dandy
- Icacinaceae Miers
- Metteniusaceae H.Karst. ex Schnizl.
- Oncothecaceae Kobuski ex Airy Shaw
- Garryales Lindl.
- Eucommiaceae Engl.
- $Garryaceae Lindl. (kaasa arvatud Aucubaceae Bercht. & J.Presl)
- Gentianales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- Lamiales Bromhead
- Solanales Juss. ex Bercht. & J.Presl
Pärisasteriidid II
- Aquifoliales Senft
- Aquifoliaceae Bercht. & J.Presl
- §Cardiopteridaceae Blume (kaasa arvatud Leptaulaceae Tiegh.)
- Helwingiaceae Decne.
- Phyllonomaceae Small
- Stemonuraceae Kårehed
- Asterales Link
- Alseuosmiaceae Airy Shaw
- Argophyllaceae Takht.
- Asteraceae Bercht. & J.Presl
- Calyceraceae R.Br. ex Rich.
- $Campanulaceae Juss. (kaasa arvatud Lobeliaceae Juss.)
- Goodeniaceae R.Br.
- Menyanthaceae Dumort.
- Pentaphragmataceae J.Agardh
- Phellinaceae Takht.
- Rousseaceae DC.
- $Stylidiaceae R.Br. (kaasa arvatud Donatiaceae B.Chandler)
- †Escalloniales R.Br.
- §Escalloniaceae R.Br. ex Dumort. (kaasa arvatud Eremosynaceae Dandy, Polyosmaceae Blume, Tribelaceae Airy Shaw)
- †Bruniales Dumort.
- Bruniaceae R.Br. ex DC.
- §Columelliaceae D.Don (kaasa arvatud Desfontainiaceae Endl.)
- †Paracryphiales Takht. ex Reveal
- §Paracryphiaceae Airy Shaw (kaasa arvatud *Quintiniaceae Doweld, Sphenostemonaceae P.Royen & Airy Shaw)
- Dipsacales Juss. ex Bercht. & J.Presl
- Apiales Nakai
- Apiaceae Lindl.
- Araliaceae Juss.
- Griseliniaceae J.R.Forst. & G.Forst. ex A.Cunn.
- Myodocarpaceae Doweld
- Pennantiaceae J.Agardh
- Pittosporaceae R.Br.
- §Torricelliaceae Hu (kaasa arvatud Aralidiaceae Philipson & B.C.Stone, Melanophyllaceae Takht. ex Airy Shaw)
Määratlemata positsiooniga taksonid
- Apodanthaceae Takht. (kolm perekonda)
- Cynomoriaceae Endl. ex Lindl.
- Gumillea Ruiz & Pav.
- Petenaea Lundell (tõenäoliselt Malvales)
- Nicobariodendron (vt Simmons, 2004; tõenäoliselt Celastraceae).
APG III süsteem põhines fülogeneetilisel puul, kuhu kuulusid kõik õistaimede 59 seltsi ja 4 määratlemata asukohaga sugukonda. Kuue ülejäänud sugukonna asetus süsteemis ei olnud võimalik kindlaks määrata ning nad on kirjas liigitustabelis "Detailne versioon".
Allpool toodud fülogeneetiline puu avaldati koos APG III süsteemiga, kuid ilma mõningate vahepealkirjadeta.
APG II süsteemis sulgudesse pandud ning APG III süsteemist välja arvatud sugukondade asemele on pakutud mitmeid alamsugukondi.[4] Need on ära toodud järgnevas tabelis.
APG II süsteemis sulgudes märgitud sugukond | APG III süsteemis alamsugukond |
Agapanthaceae | Amaryllidaceae: Agapanthoideae |
Agavaceae | Asparagaceae: Agavoideae |
Alliaceae | Amaryllidaceae: Allioideae |
Amaryllidaceae | Amaryllidaceae: Amaryllidoideae |
Aphyllanthaceae | Asparagaceae: Aphyllanthoideae |
Asparagaceae | Asparagaceae: Asparagoideae |
Asphodelaceae | Xanthorrhoeaceae: Asphodeloideae |
Hemerocallidaceae | Xanthorrhoeaceae: Hemerocallidoideae |
Hesperocallidaceae | Asparagaceae: Agavoideae |
Hyacinthaceae | Asparagaceae: Scilloideae |
Laxmanniaceae | Asparagaceae: Lomandroideae |
Ruscaceae | Asparagaceae: Nolinoideae |
Themidaceae | Asparagaceae: Brodiaeoideae |
Xanthorrhoeaceae | Xanthorrhoeaceae: Xanthorrhoeoideae |
- APG I süsteem
- APG II süsteem
- APG IV süsteem
K.Kolsar, Katteseemnetaimede sekveneerimisprojektid ja genoomiduplikatsioonid taimede evolutsioonis, TARTU ÜLIKOOL LOODUS- JA TEHNOLOOGIATEADUSKOND MOLEKULAAR- JA RAKUBIOLOOGIA INSTITUUT BIOINFORMAATIKA ÕPPETOOL, Tartu 2011
Chase, M.W.; Reveal, J.L.; Fay, M.F. (2009), "A subfamilial classification for the expanded asparagalean families Amaryllidaceae, Asparagaceae and Xanthorrhoeaceae", Botanical Journal of the Linnean Society, 161 (2): 132–136, DOI:10.1111/j.1095-8339.2009.00999.x