5S ribosomaalne RNA

5S ribosomaalne RNA (5S rRNA) on nii prokarüootide (50S) kui ka eukarüootide (60S) suurte ribosomaalsete alaühikute komponent. 5S rRNA on ligikaudu 120 nukleotiidi pikk, mis on küllaltki lühike võrreldes teiste ribosomaalsete RNA-dega. 5S rRNA-d ei leidu seente mitokondriaalsetes ribosoomides.^[3]

Krüoelektronmikroskoopia põhjal koostatud kujutis Escherichia coli 5S rRNA molekulist^[1]

Ribosoom^[2]

Eukarüootset 5S rRNA-d sünteesib RNA polümeraas III, samas kui enamik teisi eukarüootseid rRNA-sid toodetakse 45S prekursorilt, mida transkribeerib RNA polümeraas I. On näidatud, et Xenopus'e ootsüütidel üheksa tsink-sõrmelise transkriptsiooni faktori TFIIIA sõrmed 4–7 võivad seonduda 5S RNA tsentraalse piirkonnaga.^[4] Seondumine 5S rRNA ja TFIIIA vahele aitab nii represseerida edasist 5S RNA geeni transkriptsioon kui ka stabiliseerida 5S RNA transkripti nii kaua kui seda on vaja ribosoomi moodustumisel.^[5]

Interaktsioonid valkudega

5S rRNA seondub prokarüootidel ribosomaalsete valkudega L5, L18 ja L25. Eukarüootidel seondub 5S rRNA ainult ribosomaalse valgu L5-ga.^[6]

Avastamine

5S ribosomaalse RNA esmaleidjate sekka kuulub Artur Lind Tartu Riiklikust Ülikoolist.^[7]

Viited

1. Mueller F, Sommer I, Baranov P, Matadeen R, Stoldt M, Wöhnert J, Görlach M, van Heel M, Brimacombe R (2000). "The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo-electron microscopic reconstruction at 7.5 A resolution". J Mol Biol. 298 (1): 35–59. DOI:10.1006/jmbi.2000.3635. PMID 10756104.{{cite journal}}: CS1 hooldus: mitu nime: autorite loend (link)
2. Mitra K, Schaffitzel C, Fabiola F, Chapman MS, Ban N, Frank J (2006). "Elongation arrest by SecM via a cascade of ribosomal RNA rearrangements". Mol Cell. 22 (4): 533–43. DOI:10.1016/j.molcel.2006.05.003. PMID 16713583.{{cite journal}}: CS1 hooldus: mitu nime: autorite loend (link)
3. Szymanski M, Barciszewska MZ, Erdmann VA, Barciszewski J (jaanuar 2002). "5S Ribosomal RNA Database". Nucleic Acids Res. 30 (1): 176–8. DOI:10.1093/nar/30.1.176. PMC 99124. PMID 11752286.{{cite journal}}: CS1 hooldus: mitu nime: autorite loend (link)
4. Searles, MA; Lu D; Klug A (2000). "The role of the central zinc fingers of transcription factor IIIA in binding to 5 S RNA". J Mol Biol. 301 (1): 47–60. DOI:10.1006/jmbi.2000.3946. PMID 10926492.
5. Pelham, HRB; Brown DD (1980). "A specific transcription factor that can bind either the 5S RNA gene or 5S RNA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 77 (7): 4170–4174. DOI:10.1073/pnas.77.7.4170. PMC 349792. PMID 7001457.
6. Moore PB (märts 2001). "The ribosome at atomic resolution". Biochemistry. 40 (11): 3243–50. PMID 11258942.
7. Margus Maidla: "Ruum, kus sündis Eesti molekulaarbioloogia" Sirp, 14. oktoober 2016