El área natural protegida Cipresal de las Guaitecas está ubicada a unos 30 km al norte de la localidad de El Bolsón, hacia el este de la RN40, en el suroeste del departamento Bariloche, en la Patagonia argentina. Desde el punto de vista fitogeográfico, corresponde a la ecorregión del bosque andino patagónico.