El sitio de Naxos (500 a. C.-499 a. C.) fue una batalla entre los persas bajo el mando de Megabates con la ayuda de griegos jonios liderados por Aristágoras y los exiliados naxios en contra de la isla de Naxos. Fue la primera batalla de las Guerras Médicas, la cual al parecer fue el detonante para el comienzo de una guerra directa de cincuenta años entre los griegos y los persas.